Protein–RNA interactions for Protein: Q9QUK0

Cdkl2, Cyclin-dependent kinase-like 2, mousemouse

Predictions only

Length 568 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdkl2Q9QUK0 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Cdkl2Q9QUK0 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Cdkl2Q9QUK0 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Cdkl2Q9QUK0 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Cdkl2Q9QUK0 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Cdkl2Q9QUK0 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Cdkl2Q9QUK0 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Cdkl2Q9QUK0 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Cdkl2Q9QUK0 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Cdkl2Q9QUK0 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Cdkl2Q9QUK0 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Cdkl2Q9QUK0 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Cdkl2Q9QUK0 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Cdkl2Q9QUK0 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Cdkl2Q9QUK0 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Cdkl2Q9QUK0 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Cdkl2Q9QUK0 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Cdkl2Q9QUK0 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Cdkl2Q9QUK0 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Cdkl2Q9QUK0 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Cdkl2Q9QUK0 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Cdkl2Q9QUK0 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Cdkl2Q9QUK0 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Cdkl2Q9QUK0 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Cdkl2Q9QUK0 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Cdkl2Q9QUK0 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
Cdkl2Q9QUK0 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Cdkl2Q9QUK0 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Cdkl2Q9QUK0 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Cdkl2Q9QUK0 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Cdkl2Q9QUK0 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Cdkl2Q9QUK0 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Cdkl2Q9QUK0 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Cdkl2Q9QUK0 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Cdkl2Q9QUK0 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Cdkl2Q9QUK0 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Cdkl2Q9QUK0 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Cdkl2Q9QUK0 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Cdkl2Q9QUK0 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Cdkl2Q9QUK0 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Cdkl2Q9QUK0 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Cdkl2Q9QUK0 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Cdkl2Q9QUK0 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Cdkl2Q9QUK0 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Cdkl2Q9QUK0 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Cdkl2Q9QUK0 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Cdkl2Q9QUK0 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Cdkl2Q9QUK0 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Cdkl2Q9QUK0 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Cdkl2Q9QUK0 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Cdkl2Q9QUK0 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Cdkl2Q9QUK0 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Cdkl2Q9QUK0 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Cdkl2Q9QUK0 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Cdkl2Q9QUK0 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Cdkl2Q9QUK0 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Cdkl2Q9QUK0 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Cdkl2Q9QUK0 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Cdkl2Q9QUK0 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Cdkl2Q9QUK0 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Cdkl2Q9QUK0 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Cdkl2Q9QUK0 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Cdkl2Q9QUK0 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Cdkl2Q9QUK0 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Cdkl2Q9QUK0 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Cdkl2Q9QUK0 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Cdkl2Q9QUK0 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Cdkl2Q9QUK0 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Cdkl2Q9QUK0 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Cdkl2Q9QUK0 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
Cdkl2Q9QUK0 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Cdkl2Q9QUK0 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Cdkl2Q9QUK0 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Cdkl2Q9QUK0 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Cdkl2Q9QUK0 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Cdkl2Q9QUK0 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Cdkl2Q9QUK0 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Cdkl2Q9QUK0 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Cdkl2Q9QUK0 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Cdkl2Q9QUK0 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Cdkl2Q9QUK0 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Cdkl2Q9QUK0 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Cdkl2Q9QUK0 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Cdkl2Q9QUK0 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Cdkl2Q9QUK0 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Cdkl2Q9QUK0 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Cdkl2Q9QUK0 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Cdkl2Q9QUK0 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Cdkl2Q9QUK0 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Cdkl2Q9QUK0 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Cdkl2Q9QUK0 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Cdkl2Q9QUK0 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Cdkl2Q9QUK0 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Cdkl2Q9QUK0 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Cdkl2Q9QUK0 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Cdkl2Q9QUK0 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Cdkl2Q9QUK0 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Cdkl2Q9QUK0 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Cdkl2Q9QUK0 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Cdkl2Q9QUK0 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 126 ms