Protein–RNA interactions for Protein: Q9QUJ7

Acsl4, Long-chain-fatty-acid--CoA ligase 4, mousemouse

Predictions only

Length 711 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Acsl4Q9QUJ7 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Acsl4Q9QUJ7 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Acsl4Q9QUJ7 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Acsl4Q9QUJ7 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Acsl4Q9QUJ7 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Acsl4Q9QUJ7 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Acsl4Q9QUJ7 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Acsl4Q9QUJ7 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Acsl4Q9QUJ7 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Acsl4Q9QUJ7 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Acsl4Q9QUJ7 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Acsl4Q9QUJ7 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Acsl4Q9QUJ7 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Acsl4Q9QUJ7 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Acsl4Q9QUJ7 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Acsl4Q9QUJ7 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Acsl4Q9QUJ7 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Acsl4Q9QUJ7 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Acsl4Q9QUJ7 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Acsl4Q9QUJ7 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Acsl4Q9QUJ7 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Acsl4Q9QUJ7 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Acsl4Q9QUJ7 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Acsl4Q9QUJ7 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Acsl4Q9QUJ7 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Acsl4Q9QUJ7 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Acsl4Q9QUJ7 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Acsl4Q9QUJ7 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Acsl4Q9QUJ7 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Acsl4Q9QUJ7 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Acsl4Q9QUJ7 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Acsl4Q9QUJ7 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Acsl4Q9QUJ7 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Acsl4Q9QUJ7 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Acsl4Q9QUJ7 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Acsl4Q9QUJ7 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Acsl4Q9QUJ7 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Acsl4Q9QUJ7 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Acsl4Q9QUJ7 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Acsl4Q9QUJ7 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Acsl4Q9QUJ7 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Acsl4Q9QUJ7 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Acsl4Q9QUJ7 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Acsl4Q9QUJ7 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Acsl4Q9QUJ7 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Acsl4Q9QUJ7 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Acsl4Q9QUJ7 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Acsl4Q9QUJ7 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Acsl4Q9QUJ7 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Acsl4Q9QUJ7 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
Acsl4Q9QUJ7 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Acsl4Q9QUJ7 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Acsl4Q9QUJ7 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Acsl4Q9QUJ7 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Acsl4Q9QUJ7 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Acsl4Q9QUJ7 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Acsl4Q9QUJ7 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Acsl4Q9QUJ7 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Acsl4Q9QUJ7 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Acsl4Q9QUJ7 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Acsl4Q9QUJ7 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Acsl4Q9QUJ7 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Acsl4Q9QUJ7 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Acsl4Q9QUJ7 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Acsl4Q9QUJ7 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Acsl4Q9QUJ7 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Acsl4Q9QUJ7 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Acsl4Q9QUJ7 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Acsl4Q9QUJ7 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Acsl4Q9QUJ7 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Acsl4Q9QUJ7 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Acsl4Q9QUJ7 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Acsl4Q9QUJ7 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Acsl4Q9QUJ7 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Acsl4Q9QUJ7 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Acsl4Q9QUJ7 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Acsl4Q9QUJ7 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Acsl4Q9QUJ7 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Acsl4Q9QUJ7 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Acsl4Q9QUJ7 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Acsl4Q9QUJ7 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Acsl4Q9QUJ7 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Acsl4Q9QUJ7 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Acsl4Q9QUJ7 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Acsl4Q9QUJ7 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Acsl4Q9QUJ7 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Acsl4Q9QUJ7 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Acsl4Q9QUJ7 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Acsl4Q9QUJ7 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Acsl4Q9QUJ7 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Acsl4Q9QUJ7 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Acsl4Q9QUJ7 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Acsl4Q9QUJ7 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Acsl4Q9QUJ7 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Acsl4Q9QUJ7 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Acsl4Q9QUJ7 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Acsl4Q9QUJ7 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Acsl4Q9QUJ7 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Acsl4Q9QUJ7 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Acsl4Q9QUJ7 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9 ms