Protein–RNA interactions for Protein: Q9JMA7

Cyp3a41a, Cytochrome P450 3A41, mousemouse

Predictions only

Length 504 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyp3a41aQ9JMA7 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Cyp3a41aQ9JMA7 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Cyp3a41aQ9JMA7 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Cyp3a41aQ9JMA7 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Cyp3a41aQ9JMA7 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Cyp3a41aQ9JMA7 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Cyp3a41aQ9JMA7 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Cyp3a41aQ9JMA7 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Cyp3a41aQ9JMA7 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Cyp3a41aQ9JMA7 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Cyp3a41aQ9JMA7 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
Cyp3a41aQ9JMA7 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Cyp3a41aQ9JMA7 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Cyp3a41aQ9JMA7 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Cyp3a41aQ9JMA7 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Cyp3a41aQ9JMA7 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Cyp3a41aQ9JMA7 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Cyp3a41aQ9JMA7 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Cyp3a41aQ9JMA7 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Cyp3a41aQ9JMA7 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Cyp3a41aQ9JMA7 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Cyp3a41aQ9JMA7 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Cyp3a41aQ9JMA7 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Cyp3a41aQ9JMA7 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Cyp3a41aQ9JMA7 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Cyp3a41aQ9JMA7 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Cyp3a41aQ9JMA7 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Cyp3a41aQ9JMA7 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Cyp3a41aQ9JMA7 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Cyp3a41aQ9JMA7 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Cyp3a41aQ9JMA7 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Cyp3a41aQ9JMA7 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Cyp3a41aQ9JMA7 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Cyp3a41aQ9JMA7 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Cyp3a41aQ9JMA7 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Cyp3a41aQ9JMA7 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Cyp3a41aQ9JMA7 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Cyp3a41aQ9JMA7 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Cyp3a41aQ9JMA7 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Cyp3a41aQ9JMA7 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Cyp3a41aQ9JMA7 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Cyp3a41aQ9JMA7 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Cyp3a41aQ9JMA7 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Cyp3a41aQ9JMA7 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Cyp3a41aQ9JMA7 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Cyp3a41aQ9JMA7 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Cyp3a41aQ9JMA7 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Cyp3a41aQ9JMA7 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Cyp3a41aQ9JMA7 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Cyp3a41aQ9JMA7 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Cyp3a41aQ9JMA7 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Cyp3a41aQ9JMA7 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Cyp3a41aQ9JMA7 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
Cyp3a41aQ9JMA7 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Cyp3a41aQ9JMA7 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Cyp3a41aQ9JMA7 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
Cyp3a41aQ9JMA7 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Cyp3a41aQ9JMA7 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Cyp3a41aQ9JMA7 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Cyp3a41aQ9JMA7 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Cyp3a41aQ9JMA7 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Cyp3a41aQ9JMA7 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Cyp3a41aQ9JMA7 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Cyp3a41aQ9JMA7 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Cyp3a41aQ9JMA7 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Cyp3a41aQ9JMA7 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Cyp3a41aQ9JMA7 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Cyp3a41aQ9JMA7 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Cyp3a41aQ9JMA7 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Cyp3a41aQ9JMA7 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Cyp3a41aQ9JMA7 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Cyp3a41aQ9JMA7 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Cyp3a41aQ9JMA7 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Cyp3a41aQ9JMA7 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Cyp3a41aQ9JMA7 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Cyp3a41aQ9JMA7 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Cyp3a41aQ9JMA7 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Cyp3a41aQ9JMA7 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Cyp3a41aQ9JMA7 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Cyp3a41aQ9JMA7 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Cyp3a41aQ9JMA7 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Cyp3a41aQ9JMA7 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Cyp3a41aQ9JMA7 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Cyp3a41aQ9JMA7 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Cyp3a41aQ9JMA7 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Cyp3a41aQ9JMA7 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Cyp3a41aQ9JMA7 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Cyp3a41aQ9JMA7 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Cyp3a41aQ9JMA7 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Cyp3a41aQ9JMA7 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Cyp3a41aQ9JMA7 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Cyp3a41aQ9JMA7 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Cyp3a41aQ9JMA7 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Cyp3a41aQ9JMA7 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Cyp3a41aQ9JMA7 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Cyp3a41aQ9JMA7 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Cyp3a41aQ9JMA7 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Cyp3a41aQ9JMA7 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Cyp3a41aQ9JMA7 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Cyp3a41aQ9JMA7 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.7 ms