Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLV6

Pnkp, Bifunctional polynucleotide phosphatase/kinase, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 522 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PnkpQ9JLV6 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PnkpQ9JLV6 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PnkpQ9JLV6 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PnkpQ9JLV6 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PnkpQ9JLV6 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PnkpQ9JLV6 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PnkpQ9JLV6 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PnkpQ9JLV6 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PnkpQ9JLV6 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PnkpQ9JLV6 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
PnkpQ9JLV6 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
PnkpQ9JLV6 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PnkpQ9JLV6 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PnkpQ9JLV6 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PnkpQ9JLV6 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PnkpQ9JLV6 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PnkpQ9JLV6 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PnkpQ9JLV6 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PnkpQ9JLV6 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PnkpQ9JLV6 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PnkpQ9JLV6 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PnkpQ9JLV6 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PnkpQ9JLV6 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
PnkpQ9JLV6 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PnkpQ9JLV6 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
PnkpQ9JLV6 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
PnkpQ9JLV6 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PnkpQ9JLV6 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PnkpQ9JLV6 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
PnkpQ9JLV6 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PnkpQ9JLV6 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PnkpQ9JLV6 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PnkpQ9JLV6 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PnkpQ9JLV6 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PnkpQ9JLV6 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PnkpQ9JLV6 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PnkpQ9JLV6 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PnkpQ9JLV6 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PnkpQ9JLV6 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
PnkpQ9JLV6 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PnkpQ9JLV6 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PnkpQ9JLV6 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PnkpQ9JLV6 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PnkpQ9JLV6 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
PnkpQ9JLV6 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PnkpQ9JLV6 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PnkpQ9JLV6 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PnkpQ9JLV6 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PnkpQ9JLV6 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PnkpQ9JLV6 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PnkpQ9JLV6 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PnkpQ9JLV6 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PnkpQ9JLV6 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PnkpQ9JLV6 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PnkpQ9JLV6 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PnkpQ9JLV6 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PnkpQ9JLV6 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PnkpQ9JLV6 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PnkpQ9JLV6 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
PnkpQ9JLV6 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PnkpQ9JLV6 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PnkpQ9JLV6 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PnkpQ9JLV6 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PnkpQ9JLV6 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PnkpQ9JLV6 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PnkpQ9JLV6 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PnkpQ9JLV6 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PnkpQ9JLV6 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
PnkpQ9JLV6 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PnkpQ9JLV6 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PnkpQ9JLV6 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PnkpQ9JLV6 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PnkpQ9JLV6 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
PnkpQ9JLV6 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PnkpQ9JLV6 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
PnkpQ9JLV6 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PnkpQ9JLV6 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
PnkpQ9JLV6 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PnkpQ9JLV6 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
PnkpQ9JLV6 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
PnkpQ9JLV6 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PnkpQ9JLV6 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PnkpQ9JLV6 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PnkpQ9JLV6 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PnkpQ9JLV6 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PnkpQ9JLV6 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PnkpQ9JLV6 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PnkpQ9JLV6 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
PnkpQ9JLV6 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PnkpQ9JLV6 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PnkpQ9JLV6 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PnkpQ9JLV6 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PnkpQ9JLV6 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
PnkpQ9JLV6 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PnkpQ9JLV6 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PnkpQ9JLV6 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PnkpQ9JLV6 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PnkpQ9JLV6 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PnkpQ9JLV6 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PnkpQ9JLV6 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.2 ms