Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLR9

Higd1a, HIG1 domain family member 1A, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 95 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Higd1aQ9JLR9 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Higd1aQ9JLR9 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Higd1aQ9JLR9 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Higd1aQ9JLR9 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Higd1aQ9JLR9 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Higd1aQ9JLR9 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Higd1aQ9JLR9 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Higd1aQ9JLR9 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Higd1aQ9JLR9 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Higd1aQ9JLR9 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Higd1aQ9JLR9 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Higd1aQ9JLR9 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Higd1aQ9JLR9 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Higd1aQ9JLR9 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Higd1aQ9JLR9 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Higd1aQ9JLR9 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Higd1aQ9JLR9 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Higd1aQ9JLR9 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Higd1aQ9JLR9 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Higd1aQ9JLR9 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Higd1aQ9JLR9 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Higd1aQ9JLR9 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Higd1aQ9JLR9 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Higd1aQ9JLR9 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Higd1aQ9JLR9 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Higd1aQ9JLR9 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Higd1aQ9JLR9 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Higd1aQ9JLR9 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Higd1aQ9JLR9 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Higd1aQ9JLR9 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Higd1aQ9JLR9 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Higd1aQ9JLR9 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Higd1aQ9JLR9 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Higd1aQ9JLR9 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Higd1aQ9JLR9 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Higd1aQ9JLR9 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Higd1aQ9JLR9 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Higd1aQ9JLR9 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Higd1aQ9JLR9 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Higd1aQ9JLR9 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Higd1aQ9JLR9 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Higd1aQ9JLR9 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Higd1aQ9JLR9 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Higd1aQ9JLR9 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Higd1aQ9JLR9 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Higd1aQ9JLR9 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Higd1aQ9JLR9 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Higd1aQ9JLR9 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Higd1aQ9JLR9 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Higd1aQ9JLR9 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Higd1aQ9JLR9 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Higd1aQ9JLR9 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Higd1aQ9JLR9 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Higd1aQ9JLR9 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Higd1aQ9JLR9 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Higd1aQ9JLR9 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Higd1aQ9JLR9 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Higd1aQ9JLR9 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Higd1aQ9JLR9 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Higd1aQ9JLR9 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Higd1aQ9JLR9 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Higd1aQ9JLR9 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Higd1aQ9JLR9 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Higd1aQ9JLR9 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Higd1aQ9JLR9 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Higd1aQ9JLR9 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Higd1aQ9JLR9 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Higd1aQ9JLR9 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Higd1aQ9JLR9 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Higd1aQ9JLR9 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Higd1aQ9JLR9 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Higd1aQ9JLR9 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Higd1aQ9JLR9 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Higd1aQ9JLR9 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Higd1aQ9JLR9 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Higd1aQ9JLR9 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Higd1aQ9JLR9 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Higd1aQ9JLR9 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Higd1aQ9JLR9 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Higd1aQ9JLR9 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Higd1aQ9JLR9 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Higd1aQ9JLR9 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Higd1aQ9JLR9 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Higd1aQ9JLR9 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Higd1aQ9JLR9 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Higd1aQ9JLR9 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Higd1aQ9JLR9 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Higd1aQ9JLR9 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Higd1aQ9JLR9 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Higd1aQ9JLR9 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Higd1aQ9JLR9 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Higd1aQ9JLR9 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Higd1aQ9JLR9 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Higd1aQ9JLR9 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Higd1aQ9JLR9 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Higd1aQ9JLR9 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Higd1aQ9JLR9 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Higd1aQ9JLR9 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Higd1aQ9JLR9 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Higd1aQ9JLR9 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.1 ms