Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLK3

Cabp5, Calcium-binding protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 173 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cabp5Q9JLK3 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Cabp5Q9JLK3 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Cabp5Q9JLK3 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Cabp5Q9JLK3 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Cabp5Q9JLK3 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Cabp5Q9JLK3 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Cabp5Q9JLK3 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
Cabp5Q9JLK3 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Cabp5Q9JLK3 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Cabp5Q9JLK3 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Cabp5Q9JLK3 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Cabp5Q9JLK3 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Cabp5Q9JLK3 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Cabp5Q9JLK3 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Cabp5Q9JLK3 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Cabp5Q9JLK3 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Cabp5Q9JLK3 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Cabp5Q9JLK3 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Cabp5Q9JLK3 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Cabp5Q9JLK3 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Cabp5Q9JLK3 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Cabp5Q9JLK3 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Cabp5Q9JLK3 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Cabp5Q9JLK3 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
Cabp5Q9JLK3 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Cabp5Q9JLK3 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Cabp5Q9JLK3 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Cabp5Q9JLK3 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
Cabp5Q9JLK3 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.01
Cabp5Q9JLK3 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
Cabp5Q9JLK3 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Cabp5Q9JLK3 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Cabp5Q9JLK3 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Cabp5Q9JLK3 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Cabp5Q9JLK3 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Cabp5Q9JLK3 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Cabp5Q9JLK3 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Cabp5Q9JLK3 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Cabp5Q9JLK3 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
Cabp5Q9JLK3 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
Cabp5Q9JLK3 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
Cabp5Q9JLK3 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Cabp5Q9JLK3 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Cabp5Q9JLK3 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Cabp5Q9JLK3 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Cabp5Q9JLK3 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Cabp5Q9JLK3 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Cabp5Q9JLK3 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Cabp5Q9JLK3 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Cabp5Q9JLK3 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Cabp5Q9JLK3 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Cabp5Q9JLK3 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Cabp5Q9JLK3 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Cabp5Q9JLK3 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
Cabp5Q9JLK3 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Cabp5Q9JLK3 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
Cabp5Q9JLK3 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
Cabp5Q9JLK3 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Cabp5Q9JLK3 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Cabp5Q9JLK3 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Cabp5Q9JLK3 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Cabp5Q9JLK3 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Cabp5Q9JLK3 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
Cabp5Q9JLK3 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Cabp5Q9JLK3 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Cabp5Q9JLK3 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Cabp5Q9JLK3 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Cabp5Q9JLK3 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Cabp5Q9JLK3 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Cabp5Q9JLK3 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Cabp5Q9JLK3 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
Cabp5Q9JLK3 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
Cabp5Q9JLK3 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Cabp5Q9JLK3 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Cabp5Q9JLK3 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Cabp5Q9JLK3 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Cabp5Q9JLK3 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Cabp5Q9JLK3 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
Cabp5Q9JLK3 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Cabp5Q9JLK3 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Cabp5Q9JLK3 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Cabp5Q9JLK3 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Cabp5Q9JLK3 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Cabp5Q9JLK3 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Cabp5Q9JLK3 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
Cabp5Q9JLK3 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Cabp5Q9JLK3 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
Cabp5Q9JLK3 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Cabp5Q9JLK3 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Cabp5Q9JLK3 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Cabp5Q9JLK3 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Cabp5Q9JLK3 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Cabp5Q9JLK3 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Cabp5Q9JLK3 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Cabp5Q9JLK3 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Cabp5Q9JLK3 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Cabp5Q9JLK3 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Cabp5Q9JLK3 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Cabp5Q9JLK3 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Cabp5Q9JLK3 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.8 ms