Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLF7

Tlr5, Toll-like receptor 5, mousemouse

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Length 859 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tlr5Q9JLF7 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Tlr5Q9JLF7 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Tlr5Q9JLF7 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Tlr5Q9JLF7 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Tlr5Q9JLF7 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
Tlr5Q9JLF7 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Tlr5Q9JLF7 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Tlr5Q9JLF7 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
Tlr5Q9JLF7 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Tlr5Q9JLF7 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Tlr5Q9JLF7 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Tlr5Q9JLF7 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
Tlr5Q9JLF7 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Tlr5Q9JLF7 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Tlr5Q9JLF7 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Tlr5Q9JLF7 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Tlr5Q9JLF7 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Tlr5Q9JLF7 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Tlr5Q9JLF7 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Tlr5Q9JLF7 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Tlr5Q9JLF7 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Tlr5Q9JLF7 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Tlr5Q9JLF7 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
Tlr5Q9JLF7 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Tlr5Q9JLF7 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Tlr5Q9JLF7 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Tlr5Q9JLF7 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Tlr5Q9JLF7 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
Tlr5Q9JLF7 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
Tlr5Q9JLF7 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.89
Tlr5Q9JLF7 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Tlr5Q9JLF7 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Tlr5Q9JLF7 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Tlr5Q9JLF7 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Tlr5Q9JLF7 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Tlr5Q9JLF7 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Tlr5Q9JLF7 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Tlr5Q9JLF7 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Tlr5Q9JLF7 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Tlr5Q9JLF7 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Tlr5Q9JLF7 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Tlr5Q9JLF7 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Tlr5Q9JLF7 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Tlr5Q9JLF7 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Tlr5Q9JLF7 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
Tlr5Q9JLF7 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Tlr5Q9JLF7 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
Tlr5Q9JLF7 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Tlr5Q9JLF7 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Tlr5Q9JLF7 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Tlr5Q9JLF7 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
Tlr5Q9JLF7 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Tlr5Q9JLF7 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Tlr5Q9JLF7 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Tlr5Q9JLF7 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Tlr5Q9JLF7 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
Tlr5Q9JLF7 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Tlr5Q9JLF7 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Tlr5Q9JLF7 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Tlr5Q9JLF7 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Tlr5Q9JLF7 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Tlr5Q9JLF7 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Tlr5Q9JLF7 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Tlr5Q9JLF7 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Tlr5Q9JLF7 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Tlr5Q9JLF7 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
Tlr5Q9JLF7 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Tlr5Q9JLF7 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Tlr5Q9JLF7 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Tlr5Q9JLF7 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Tlr5Q9JLF7 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Tlr5Q9JLF7 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Tlr5Q9JLF7 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Tlr5Q9JLF7 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Tlr5Q9JLF7 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Tlr5Q9JLF7 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Tlr5Q9JLF7 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Tlr5Q9JLF7 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Tlr5Q9JLF7 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Tlr5Q9JLF7 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
Tlr5Q9JLF7 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Tlr5Q9JLF7 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Tlr5Q9JLF7 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Tlr5Q9JLF7 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Tlr5Q9JLF7 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Tlr5Q9JLF7 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
Tlr5Q9JLF7 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Tlr5Q9JLF7 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Tlr5Q9JLF7 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Tlr5Q9JLF7 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Tlr5Q9JLF7 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Tlr5Q9JLF7 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Tlr5Q9JLF7 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Tlr5Q9JLF7 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Tlr5Q9JLF7 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Tlr5Q9JLF7 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Tlr5Q9JLF7 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Tlr5Q9JLF7 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Tlr5Q9JLF7 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Tlr5Q9JLF7 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 127.7 ms