Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLC4

Sorcs1, VPS10 domain-containing receptor SorCS1, mousemouse

Predictions only

Length 1,167 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sorcs1Q9JLC4 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Sorcs1Q9JLC4 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Sorcs1Q9JLC4 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Sorcs1Q9JLC4 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Sorcs1Q9JLC4 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Sorcs1Q9JLC4 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Sorcs1Q9JLC4 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Sorcs1Q9JLC4 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Sorcs1Q9JLC4 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Sorcs1Q9JLC4 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Sorcs1Q9JLC4 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Sorcs1Q9JLC4 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Sorcs1Q9JLC4 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Sorcs1Q9JLC4 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Sorcs1Q9JLC4 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Sorcs1Q9JLC4 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Sorcs1Q9JLC4 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Sorcs1Q9JLC4 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Sorcs1Q9JLC4 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Sorcs1Q9JLC4 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Sorcs1Q9JLC4 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Sorcs1Q9JLC4 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Sorcs1Q9JLC4 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Sorcs1Q9JLC4 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Sorcs1Q9JLC4 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Sorcs1Q9JLC4 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Sorcs1Q9JLC4 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Sorcs1Q9JLC4 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Sorcs1Q9JLC4 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Sorcs1Q9JLC4 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Sorcs1Q9JLC4 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Sorcs1Q9JLC4 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Sorcs1Q9JLC4 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Sorcs1Q9JLC4 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Sorcs1Q9JLC4 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Sorcs1Q9JLC4 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Sorcs1Q9JLC4 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Sorcs1Q9JLC4 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Sorcs1Q9JLC4 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Sorcs1Q9JLC4 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Sorcs1Q9JLC4 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Sorcs1Q9JLC4 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Sorcs1Q9JLC4 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Sorcs1Q9JLC4 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Sorcs1Q9JLC4 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Sorcs1Q9JLC4 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Sorcs1Q9JLC4 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Sorcs1Q9JLC4 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Sorcs1Q9JLC4 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Sorcs1Q9JLC4 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Sorcs1Q9JLC4 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Sorcs1Q9JLC4 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Sorcs1Q9JLC4 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Sorcs1Q9JLC4 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Sorcs1Q9JLC4 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Sorcs1Q9JLC4 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Sorcs1Q9JLC4 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Sorcs1Q9JLC4 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Sorcs1Q9JLC4 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Sorcs1Q9JLC4 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Sorcs1Q9JLC4 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Sorcs1Q9JLC4 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Sorcs1Q9JLC4 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Sorcs1Q9JLC4 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Sorcs1Q9JLC4 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Sorcs1Q9JLC4 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Sorcs1Q9JLC4 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Sorcs1Q9JLC4 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Sorcs1Q9JLC4 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Sorcs1Q9JLC4 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Sorcs1Q9JLC4 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Sorcs1Q9JLC4 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Sorcs1Q9JLC4 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Sorcs1Q9JLC4 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Sorcs1Q9JLC4 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Sorcs1Q9JLC4 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Sorcs1Q9JLC4 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Sorcs1Q9JLC4 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Sorcs1Q9JLC4 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Sorcs1Q9JLC4 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Sorcs1Q9JLC4 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Sorcs1Q9JLC4 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Sorcs1Q9JLC4 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Sorcs1Q9JLC4 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Sorcs1Q9JLC4 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Sorcs1Q9JLC4 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Sorcs1Q9JLC4 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Sorcs1Q9JLC4 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Sorcs1Q9JLC4 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Sorcs1Q9JLC4 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Sorcs1Q9JLC4 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Sorcs1Q9JLC4 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Sorcs1Q9JLC4 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Sorcs1Q9JLC4 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Sorcs1Q9JLC4 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Sorcs1Q9JLC4 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Sorcs1Q9JLC4 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Sorcs1Q9JLC4 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Sorcs1Q9JLC4 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Sorcs1Q9JLC4 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms