Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLB9

Nectin3, Nectin-3, mousemouse

Predictions only

Length 549 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nectin3Q9JLB9 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Nectin3Q9JLB9 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Nectin3Q9JLB9 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Nectin3Q9JLB9 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Nectin3Q9JLB9 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Nectin3Q9JLB9 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Nectin3Q9JLB9 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Nectin3Q9JLB9 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Nectin3Q9JLB9 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Nectin3Q9JLB9 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Nectin3Q9JLB9 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Nectin3Q9JLB9 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Nectin3Q9JLB9 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Nectin3Q9JLB9 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Nectin3Q9JLB9 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Nectin3Q9JLB9 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Nectin3Q9JLB9 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Nectin3Q9JLB9 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Nectin3Q9JLB9 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Nectin3Q9JLB9 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Nectin3Q9JLB9 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Nectin3Q9JLB9 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Nectin3Q9JLB9 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Nectin3Q9JLB9 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Nectin3Q9JLB9 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Nectin3Q9JLB9 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Nectin3Q9JLB9 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Nectin3Q9JLB9 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Nectin3Q9JLB9 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Nectin3Q9JLB9 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Nectin3Q9JLB9 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Nectin3Q9JLB9 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Nectin3Q9JLB9 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Nectin3Q9JLB9 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Nectin3Q9JLB9 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Nectin3Q9JLB9 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Nectin3Q9JLB9 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Nectin3Q9JLB9 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Nectin3Q9JLB9 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Nectin3Q9JLB9 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Nectin3Q9JLB9 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Nectin3Q9JLB9 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Nectin3Q9JLB9 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Nectin3Q9JLB9 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Nectin3Q9JLB9 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Nectin3Q9JLB9 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Nectin3Q9JLB9 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Nectin3Q9JLB9 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Nectin3Q9JLB9 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Nectin3Q9JLB9 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Nectin3Q9JLB9 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Nectin3Q9JLB9 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Nectin3Q9JLB9 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Nectin3Q9JLB9 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Nectin3Q9JLB9 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Nectin3Q9JLB9 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Nectin3Q9JLB9 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Nectin3Q9JLB9 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Nectin3Q9JLB9 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Nectin3Q9JLB9 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Nectin3Q9JLB9 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Nectin3Q9JLB9 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Nectin3Q9JLB9 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Nectin3Q9JLB9 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Nectin3Q9JLB9 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Nectin3Q9JLB9 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Nectin3Q9JLB9 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Nectin3Q9JLB9 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Nectin3Q9JLB9 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Nectin3Q9JLB9 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Nectin3Q9JLB9 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Nectin3Q9JLB9 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Nectin3Q9JLB9 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Nectin3Q9JLB9 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Nectin3Q9JLB9 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Nectin3Q9JLB9 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Nectin3Q9JLB9 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Nectin3Q9JLB9 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Nectin3Q9JLB9 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Nectin3Q9JLB9 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Nectin3Q9JLB9 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Nectin3Q9JLB9 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Nectin3Q9JLB9 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Nectin3Q9JLB9 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Nectin3Q9JLB9 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Nectin3Q9JLB9 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Nectin3Q9JLB9 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Nectin3Q9JLB9 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Nectin3Q9JLB9 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Nectin3Q9JLB9 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Nectin3Q9JLB9 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Nectin3Q9JLB9 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Nectin3Q9JLB9 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Nectin3Q9JLB9 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Nectin3Q9JLB9 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Nectin3Q9JLB9 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Nectin3Q9JLB9 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Nectin3Q9JLB9 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Nectin3Q9JLB9 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Nectin3Q9JLB9 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms