Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJR7

Ascl3, Achaete-scute homolog 3, mousemouse

Predictions only

Length 174 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ascl3Q9JJR7 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Ascl3Q9JJR7 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
Ascl3Q9JJR7 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Ascl3Q9JJR7 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Ascl3Q9JJR7 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ascl3Q9JJR7 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Ascl3Q9JJR7 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Ascl3Q9JJR7 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Ascl3Q9JJR7 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Ascl3Q9JJR7 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
Ascl3Q9JJR7 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Ascl3Q9JJR7 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Ascl3Q9JJR7 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Ascl3Q9JJR7 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ascl3Q9JJR7 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ascl3Q9JJR7 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ascl3Q9JJR7 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ascl3Q9JJR7 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ascl3Q9JJR7 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ascl3Q9JJR7 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ascl3Q9JJR7 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ascl3Q9JJR7 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ascl3Q9JJR7 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ascl3Q9JJR7 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ascl3Q9JJR7 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ascl3Q9JJR7 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Ascl3Q9JJR7 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Ascl3Q9JJR7 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Ascl3Q9JJR7 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ascl3Q9JJR7 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ascl3Q9JJR7 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ascl3Q9JJR7 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ascl3Q9JJR7 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ascl3Q9JJR7 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ascl3Q9JJR7 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Ascl3Q9JJR7 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Ascl3Q9JJR7 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Ascl3Q9JJR7 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ascl3Q9JJR7 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
Ascl3Q9JJR7 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ascl3Q9JJR7 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ascl3Q9JJR7 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ascl3Q9JJR7 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ascl3Q9JJR7 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ascl3Q9JJR7 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ascl3Q9JJR7 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ascl3Q9JJR7 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ascl3Q9JJR7 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ascl3Q9JJR7 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ascl3Q9JJR7 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ascl3Q9JJR7 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ascl3Q9JJR7 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Ascl3Q9JJR7 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Ascl3Q9JJR7 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ascl3Q9JJR7 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ascl3Q9JJR7 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ascl3Q9JJR7 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ascl3Q9JJR7 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ascl3Q9JJR7 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ascl3Q9JJR7 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ascl3Q9JJR7 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ascl3Q9JJR7 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ascl3Q9JJR7 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Ascl3Q9JJR7 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ascl3Q9JJR7 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ascl3Q9JJR7 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ascl3Q9JJR7 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ascl3Q9JJR7 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ascl3Q9JJR7 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ascl3Q9JJR7 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ascl3Q9JJR7 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ascl3Q9JJR7 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ascl3Q9JJR7 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ascl3Q9JJR7 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ascl3Q9JJR7 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ascl3Q9JJR7 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ascl3Q9JJR7 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ascl3Q9JJR7 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ascl3Q9JJR7 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ascl3Q9JJR7 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ascl3Q9JJR7 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ascl3Q9JJR7 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ascl3Q9JJR7 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ascl3Q9JJR7 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ascl3Q9JJR7 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Ascl3Q9JJR7 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ascl3Q9JJR7 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Ascl3Q9JJR7 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ascl3Q9JJR7 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ascl3Q9JJR7 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ascl3Q9JJR7 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ascl3Q9JJR7 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ascl3Q9JJR7 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ascl3Q9JJR7 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ascl3Q9JJR7 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
Ascl3Q9JJR7 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ascl3Q9JJR7 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ascl3Q9JJR7 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ascl3Q9JJR7 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ascl3Q9JJR7 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 104.7 ms