Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIT0

Lmbr1, Limb region 1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 490 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmbr1Q9JIT0 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Lmbr1Q9JIT0 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
Lmbr1Q9JIT0 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Lmbr1Q9JIT0 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Lmbr1Q9JIT0 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Lmbr1Q9JIT0 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Lmbr1Q9JIT0 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Lmbr1Q9JIT0 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Lmbr1Q9JIT0 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Lmbr1Q9JIT0 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Lmbr1Q9JIT0 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Lmbr1Q9JIT0 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Lmbr1Q9JIT0 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Lmbr1Q9JIT0 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Lmbr1Q9JIT0 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Lmbr1Q9JIT0 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Lmbr1Q9JIT0 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Lmbr1Q9JIT0 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Lmbr1Q9JIT0 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Lmbr1Q9JIT0 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Lmbr1Q9JIT0 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Lmbr1Q9JIT0 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Lmbr1Q9JIT0 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
Lmbr1Q9JIT0 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
Lmbr1Q9JIT0 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Lmbr1Q9JIT0 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Lmbr1Q9JIT0 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Lmbr1Q9JIT0 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Lmbr1Q9JIT0 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Lmbr1Q9JIT0 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Lmbr1Q9JIT0 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Lmbr1Q9JIT0 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Lmbr1Q9JIT0 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
Lmbr1Q9JIT0 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.09
Lmbr1Q9JIT0 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Lmbr1Q9JIT0 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Lmbr1Q9JIT0 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Lmbr1Q9JIT0 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Lmbr1Q9JIT0 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Lmbr1Q9JIT0 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Lmbr1Q9JIT0 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Lmbr1Q9JIT0 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Lmbr1Q9JIT0 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Lmbr1Q9JIT0 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Lmbr1Q9JIT0 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Lmbr1Q9JIT0 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Lmbr1Q9JIT0 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Lmbr1Q9JIT0 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Lmbr1Q9JIT0 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Lmbr1Q9JIT0 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Lmbr1Q9JIT0 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Lmbr1Q9JIT0 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Lmbr1Q9JIT0 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Lmbr1Q9JIT0 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Lmbr1Q9JIT0 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Lmbr1Q9JIT0 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Lmbr1Q9JIT0 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Lmbr1Q9JIT0 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Lmbr1Q9JIT0 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Lmbr1Q9JIT0 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Lmbr1Q9JIT0 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Lmbr1Q9JIT0 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Lmbr1Q9JIT0 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Lmbr1Q9JIT0 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Lmbr1Q9JIT0 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
Lmbr1Q9JIT0 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Lmbr1Q9JIT0 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Lmbr1Q9JIT0 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Lmbr1Q9JIT0 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Lmbr1Q9JIT0 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Lmbr1Q9JIT0 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Lmbr1Q9JIT0 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Lmbr1Q9JIT0 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
Lmbr1Q9JIT0 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Lmbr1Q9JIT0 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Lmbr1Q9JIT0 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Lmbr1Q9JIT0 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Lmbr1Q9JIT0 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Lmbr1Q9JIT0 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
Lmbr1Q9JIT0 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC27.95■■■□□ 2.07
Lmbr1Q9JIT0 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Lmbr1Q9JIT0 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Lmbr1Q9JIT0 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Lmbr1Q9JIT0 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Lmbr1Q9JIT0 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Lmbr1Q9JIT0 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Lmbr1Q9JIT0 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Lmbr1Q9JIT0 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Lmbr1Q9JIT0 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Lmbr1Q9JIT0 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Lmbr1Q9JIT0 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Lmbr1Q9JIT0 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Lmbr1Q9JIT0 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Lmbr1Q9JIT0 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Lmbr1Q9JIT0 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Lmbr1Q9JIT0 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Lmbr1Q9JIT0 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
Lmbr1Q9JIT0 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Lmbr1Q9JIT0 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
Lmbr1Q9JIT0 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.3 ms