Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIM1

Slc29a1, Equilibrative nucleoside transporter 1, mousemouse

Predictions only

Length 460 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc29a1Q9JIM1 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Slc29a1Q9JIM1 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Slc29a1Q9JIM1 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Slc29a1Q9JIM1 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Slc29a1Q9JIM1 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Slc29a1Q9JIM1 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Slc29a1Q9JIM1 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Slc29a1Q9JIM1 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Slc29a1Q9JIM1 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Slc29a1Q9JIM1 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Slc29a1Q9JIM1 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Slc29a1Q9JIM1 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Slc29a1Q9JIM1 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Slc29a1Q9JIM1 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Slc29a1Q9JIM1 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
Slc29a1Q9JIM1 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Slc29a1Q9JIM1 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Slc29a1Q9JIM1 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Slc29a1Q9JIM1 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Slc29a1Q9JIM1 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Slc29a1Q9JIM1 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Slc29a1Q9JIM1 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Slc29a1Q9JIM1 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Slc29a1Q9JIM1 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Slc29a1Q9JIM1 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Slc29a1Q9JIM1 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Slc29a1Q9JIM1 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Slc29a1Q9JIM1 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Slc29a1Q9JIM1 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
Slc29a1Q9JIM1 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Slc29a1Q9JIM1 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Slc29a1Q9JIM1 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Slc29a1Q9JIM1 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Slc29a1Q9JIM1 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Slc29a1Q9JIM1 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Slc29a1Q9JIM1 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Slc29a1Q9JIM1 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Slc29a1Q9JIM1 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Slc29a1Q9JIM1 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Slc29a1Q9JIM1 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Slc29a1Q9JIM1 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Slc29a1Q9JIM1 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Slc29a1Q9JIM1 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Slc29a1Q9JIM1 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Slc29a1Q9JIM1 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Slc29a1Q9JIM1 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Slc29a1Q9JIM1 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Slc29a1Q9JIM1 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Slc29a1Q9JIM1 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Slc29a1Q9JIM1 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Slc29a1Q9JIM1 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Slc29a1Q9JIM1 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Slc29a1Q9JIM1 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Slc29a1Q9JIM1 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Slc29a1Q9JIM1 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Slc29a1Q9JIM1 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Slc29a1Q9JIM1 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Slc29a1Q9JIM1 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
Slc29a1Q9JIM1 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Slc29a1Q9JIM1 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Slc29a1Q9JIM1 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Slc29a1Q9JIM1 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Slc29a1Q9JIM1 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Slc29a1Q9JIM1 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Slc29a1Q9JIM1 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Slc29a1Q9JIM1 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Slc29a1Q9JIM1 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Slc29a1Q9JIM1 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Slc29a1Q9JIM1 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Slc29a1Q9JIM1 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Slc29a1Q9JIM1 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Slc29a1Q9JIM1 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Slc29a1Q9JIM1 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Slc29a1Q9JIM1 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Slc29a1Q9JIM1 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Slc29a1Q9JIM1 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Slc29a1Q9JIM1 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Slc29a1Q9JIM1 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Slc29a1Q9JIM1 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Slc29a1Q9JIM1 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Slc29a1Q9JIM1 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Slc29a1Q9JIM1 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Slc29a1Q9JIM1 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Slc29a1Q9JIM1 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Slc29a1Q9JIM1 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Slc29a1Q9JIM1 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Slc29a1Q9JIM1 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Slc29a1Q9JIM1 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Slc29a1Q9JIM1 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Slc29a1Q9JIM1 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Slc29a1Q9JIM1 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Slc29a1Q9JIM1 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Slc29a1Q9JIM1 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Slc29a1Q9JIM1 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Slc29a1Q9JIM1 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Slc29a1Q9JIM1 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Slc29a1Q9JIM1 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Slc29a1Q9JIM1 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Slc29a1Q9JIM1 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Slc29a1Q9JIM1 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.7 ms