Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIH2

Nup50, Nuclear pore complex protein Nup50, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup50Q9JIH2 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Nup50Q9JIH2 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Nup50Q9JIH2 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
Nup50Q9JIH2 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Nup50Q9JIH2 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Nup50Q9JIH2 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Nup50Q9JIH2 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Nup50Q9JIH2 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Nup50Q9JIH2 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Nup50Q9JIH2 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Nup50Q9JIH2 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Nup50Q9JIH2 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Nup50Q9JIH2 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Nup50Q9JIH2 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Nup50Q9JIH2 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
Nup50Q9JIH2 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Nup50Q9JIH2 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
Nup50Q9JIH2 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Nup50Q9JIH2 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Nup50Q9JIH2 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Nup50Q9JIH2 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Nup50Q9JIH2 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Nup50Q9JIH2 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Nup50Q9JIH2 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Nup50Q9JIH2 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Nup50Q9JIH2 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Nup50Q9JIH2 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Nup50Q9JIH2 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Nup50Q9JIH2 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Nup50Q9JIH2 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Nup50Q9JIH2 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Nup50Q9JIH2 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
Nup50Q9JIH2 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Nup50Q9JIH2 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Nup50Q9JIH2 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Nup50Q9JIH2 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Nup50Q9JIH2 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Nup50Q9JIH2 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Nup50Q9JIH2 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Nup50Q9JIH2 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Nup50Q9JIH2 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
Nup50Q9JIH2 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Nup50Q9JIH2 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Nup50Q9JIH2 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Nup50Q9JIH2 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Nup50Q9JIH2 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Nup50Q9JIH2 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Nup50Q9JIH2 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Nup50Q9JIH2 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Nup50Q9JIH2 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Nup50Q9JIH2 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Nup50Q9JIH2 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Nup50Q9JIH2 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Nup50Q9JIH2 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Nup50Q9JIH2 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Nup50Q9JIH2 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Nup50Q9JIH2 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Nup50Q9JIH2 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Nup50Q9JIH2 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Nup50Q9JIH2 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Nup50Q9JIH2 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Nup50Q9JIH2 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Nup50Q9JIH2 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Nup50Q9JIH2 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Nup50Q9JIH2 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Nup50Q9JIH2 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Nup50Q9JIH2 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Nup50Q9JIH2 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Nup50Q9JIH2 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Nup50Q9JIH2 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Nup50Q9JIH2 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Nup50Q9JIH2 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Nup50Q9JIH2 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Nup50Q9JIH2 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Nup50Q9JIH2 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Nup50Q9JIH2 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Nup50Q9JIH2 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Nup50Q9JIH2 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Nup50Q9JIH2 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Nup50Q9JIH2 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Nup50Q9JIH2 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Nup50Q9JIH2 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Nup50Q9JIH2 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
Nup50Q9JIH2 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Nup50Q9JIH2 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Nup50Q9JIH2 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Nup50Q9JIH2 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Nup50Q9JIH2 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Nup50Q9JIH2 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Nup50Q9JIH2 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Nup50Q9JIH2 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Nup50Q9JIH2 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Nup50Q9JIH2 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Nup50Q9JIH2 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Nup50Q9JIH2 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Nup50Q9JIH2 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Nup50Q9JIH2 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Nup50Q9JIH2 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Nup50Q9JIH2 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Nup50Q9JIH2 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.2 ms