Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIA1

Lgi1, Leucine-rich glioma-inactivated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 557 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lgi1Q9JIA1 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Lgi1Q9JIA1 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Lgi1Q9JIA1 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Lgi1Q9JIA1 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Lgi1Q9JIA1 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Lgi1Q9JIA1 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Lgi1Q9JIA1 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Lgi1Q9JIA1 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Lgi1Q9JIA1 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Lgi1Q9JIA1 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Lgi1Q9JIA1 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Lgi1Q9JIA1 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Lgi1Q9JIA1 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Lgi1Q9JIA1 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Lgi1Q9JIA1 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Lgi1Q9JIA1 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Lgi1Q9JIA1 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Lgi1Q9JIA1 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Lgi1Q9JIA1 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Lgi1Q9JIA1 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Lgi1Q9JIA1 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Lgi1Q9JIA1 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Lgi1Q9JIA1 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Lgi1Q9JIA1 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Lgi1Q9JIA1 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Lgi1Q9JIA1 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Lgi1Q9JIA1 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Lgi1Q9JIA1 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Lgi1Q9JIA1 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Lgi1Q9JIA1 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Lgi1Q9JIA1 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Lgi1Q9JIA1 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Lgi1Q9JIA1 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Lgi1Q9JIA1 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Lgi1Q9JIA1 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Lgi1Q9JIA1 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Lgi1Q9JIA1 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Lgi1Q9JIA1 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Lgi1Q9JIA1 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Lgi1Q9JIA1 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Lgi1Q9JIA1 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Lgi1Q9JIA1 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Lgi1Q9JIA1 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Lgi1Q9JIA1 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Lgi1Q9JIA1 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Lgi1Q9JIA1 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Lgi1Q9JIA1 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Lgi1Q9JIA1 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Lgi1Q9JIA1 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Lgi1Q9JIA1 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Lgi1Q9JIA1 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Lgi1Q9JIA1 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Lgi1Q9JIA1 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Lgi1Q9JIA1 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Lgi1Q9JIA1 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Lgi1Q9JIA1 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Lgi1Q9JIA1 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Lgi1Q9JIA1 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Lgi1Q9JIA1 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Lgi1Q9JIA1 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Lgi1Q9JIA1 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Lgi1Q9JIA1 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Lgi1Q9JIA1 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Lgi1Q9JIA1 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Lgi1Q9JIA1 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Lgi1Q9JIA1 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Lgi1Q9JIA1 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Lgi1Q9JIA1 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Lgi1Q9JIA1 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Lgi1Q9JIA1 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Lgi1Q9JIA1 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Lgi1Q9JIA1 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Lgi1Q9JIA1 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Lgi1Q9JIA1 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Lgi1Q9JIA1 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Lgi1Q9JIA1 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Lgi1Q9JIA1 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Lgi1Q9JIA1 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Lgi1Q9JIA1 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Lgi1Q9JIA1 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Lgi1Q9JIA1 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Lgi1Q9JIA1 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Lgi1Q9JIA1 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Lgi1Q9JIA1 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Lgi1Q9JIA1 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Lgi1Q9JIA1 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Lgi1Q9JIA1 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Lgi1Q9JIA1 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Lgi1Q9JIA1 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Lgi1Q9JIA1 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Lgi1Q9JIA1 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Lgi1Q9JIA1 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Lgi1Q9JIA1 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Lgi1Q9JIA1 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Lgi1Q9JIA1 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Lgi1Q9JIA1 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Lgi1Q9JIA1 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Lgi1Q9JIA1 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Lgi1Q9JIA1 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Lgi1Q9JIA1 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.5 ms