Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESN6

Trim2, Tripartite motif-containing protein 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 744 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim2Q9ESN6 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Trim2Q9ESN6 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Trim2Q9ESN6 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Trim2Q9ESN6 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Trim2Q9ESN6 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Trim2Q9ESN6 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Trim2Q9ESN6 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Trim2Q9ESN6 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Trim2Q9ESN6 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Trim2Q9ESN6 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Trim2Q9ESN6 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Trim2Q9ESN6 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Trim2Q9ESN6 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Trim2Q9ESN6 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Trim2Q9ESN6 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Trim2Q9ESN6 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Trim2Q9ESN6 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Trim2Q9ESN6 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Trim2Q9ESN6 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Trim2Q9ESN6 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Trim2Q9ESN6 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Trim2Q9ESN6 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Trim2Q9ESN6 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Trim2Q9ESN6 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Trim2Q9ESN6 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Trim2Q9ESN6 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Trim2Q9ESN6 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Trim2Q9ESN6 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Trim2Q9ESN6 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Trim2Q9ESN6 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Trim2Q9ESN6 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Trim2Q9ESN6 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Trim2Q9ESN6 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Trim2Q9ESN6 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Trim2Q9ESN6 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Trim2Q9ESN6 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Trim2Q9ESN6 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Trim2Q9ESN6 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Trim2Q9ESN6 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Trim2Q9ESN6 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Trim2Q9ESN6 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Trim2Q9ESN6 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Trim2Q9ESN6 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Trim2Q9ESN6 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Trim2Q9ESN6 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Trim2Q9ESN6 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Trim2Q9ESN6 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Trim2Q9ESN6 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Trim2Q9ESN6 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Trim2Q9ESN6 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Trim2Q9ESN6 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Trim2Q9ESN6 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Trim2Q9ESN6 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Trim2Q9ESN6 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Trim2Q9ESN6 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Trim2Q9ESN6 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Trim2Q9ESN6 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Trim2Q9ESN6 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Trim2Q9ESN6 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Trim2Q9ESN6 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Trim2Q9ESN6 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Trim2Q9ESN6 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Trim2Q9ESN6 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Trim2Q9ESN6 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Trim2Q9ESN6 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Trim2Q9ESN6 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Trim2Q9ESN6 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Trim2Q9ESN6 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Trim2Q9ESN6 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Trim2Q9ESN6 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Trim2Q9ESN6 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Trim2Q9ESN6 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Trim2Q9ESN6 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Trim2Q9ESN6 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Trim2Q9ESN6 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Trim2Q9ESN6 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Trim2Q9ESN6 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Trim2Q9ESN6 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Trim2Q9ESN6 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Trim2Q9ESN6 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Trim2Q9ESN6 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Trim2Q9ESN6 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Trim2Q9ESN6 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Trim2Q9ESN6 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Trim2Q9ESN6 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Trim2Q9ESN6 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Trim2Q9ESN6 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Trim2Q9ESN6 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Trim2Q9ESN6 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Trim2Q9ESN6 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Trim2Q9ESN6 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Trim2Q9ESN6 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Trim2Q9ESN6 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Trim2Q9ESN6 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Trim2Q9ESN6 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Trim2Q9ESN6 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Trim2Q9ESN6 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Trim2Q9ESN6 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Trim2Q9ESN6 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Trim2Q9ESN6 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.7 ms