Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERH8

Slc28a3, Solute carrier family 28 member 3, mousemouse

Predictions only

Length 703 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc28a3Q9ERH8 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Slc28a3Q9ERH8 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Slc28a3Q9ERH8 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Slc28a3Q9ERH8 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Slc28a3Q9ERH8 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Slc28a3Q9ERH8 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Slc28a3Q9ERH8 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Slc28a3Q9ERH8 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Slc28a3Q9ERH8 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Slc28a3Q9ERH8 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Slc28a3Q9ERH8 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Slc28a3Q9ERH8 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Slc28a3Q9ERH8 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Slc28a3Q9ERH8 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Slc28a3Q9ERH8 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Slc28a3Q9ERH8 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Slc28a3Q9ERH8 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Slc28a3Q9ERH8 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Slc28a3Q9ERH8 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Slc28a3Q9ERH8 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Slc28a3Q9ERH8 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Slc28a3Q9ERH8 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Slc28a3Q9ERH8 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Slc28a3Q9ERH8 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Slc28a3Q9ERH8 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Slc28a3Q9ERH8 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Slc28a3Q9ERH8 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Slc28a3Q9ERH8 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Slc28a3Q9ERH8 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Slc28a3Q9ERH8 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Slc28a3Q9ERH8 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Slc28a3Q9ERH8 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Slc28a3Q9ERH8 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Slc28a3Q9ERH8 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Slc28a3Q9ERH8 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Slc28a3Q9ERH8 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Slc28a3Q9ERH8 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Slc28a3Q9ERH8 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Slc28a3Q9ERH8 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Slc28a3Q9ERH8 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Slc28a3Q9ERH8 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Slc28a3Q9ERH8 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Slc28a3Q9ERH8 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Slc28a3Q9ERH8 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Slc28a3Q9ERH8 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Slc28a3Q9ERH8 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Slc28a3Q9ERH8 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Slc28a3Q9ERH8 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Slc28a3Q9ERH8 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Slc28a3Q9ERH8 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Slc28a3Q9ERH8 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Slc28a3Q9ERH8 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Slc28a3Q9ERH8 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Slc28a3Q9ERH8 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Slc28a3Q9ERH8 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Slc28a3Q9ERH8 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Slc28a3Q9ERH8 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Slc28a3Q9ERH8 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Slc28a3Q9ERH8 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Slc28a3Q9ERH8 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Slc28a3Q9ERH8 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Slc28a3Q9ERH8 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Slc28a3Q9ERH8 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Slc28a3Q9ERH8 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Slc28a3Q9ERH8 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Slc28a3Q9ERH8 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Slc28a3Q9ERH8 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Slc28a3Q9ERH8 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Slc28a3Q9ERH8 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Slc28a3Q9ERH8 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Slc28a3Q9ERH8 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Slc28a3Q9ERH8 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Slc28a3Q9ERH8 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Slc28a3Q9ERH8 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Slc28a3Q9ERH8 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Slc28a3Q9ERH8 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Slc28a3Q9ERH8 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Slc28a3Q9ERH8 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Slc28a3Q9ERH8 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Slc28a3Q9ERH8 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Slc28a3Q9ERH8 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Slc28a3Q9ERH8 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Slc28a3Q9ERH8 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Slc28a3Q9ERH8 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
Slc28a3Q9ERH8 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Slc28a3Q9ERH8 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Slc28a3Q9ERH8 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Slc28a3Q9ERH8 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Slc28a3Q9ERH8 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Slc28a3Q9ERH8 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
Slc28a3Q9ERH8 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Slc28a3Q9ERH8 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Slc28a3Q9ERH8 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Slc28a3Q9ERH8 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Slc28a3Q9ERH8 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Slc28a3Q9ERH8 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Slc28a3Q9ERH8 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Slc28a3Q9ERH8 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
Slc28a3Q9ERH8 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Slc28a3Q9ERH8 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.4 ms