Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERB0

Snap29, Synaptosomal-associated protein 29, mousemouse

Predictions only

Length 260 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snap29Q9ERB0 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Snap29Q9ERB0 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Snap29Q9ERB0 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Snap29Q9ERB0 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Snap29Q9ERB0 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Snap29Q9ERB0 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Snap29Q9ERB0 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Snap29Q9ERB0 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Snap29Q9ERB0 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Snap29Q9ERB0 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Snap29Q9ERB0 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Snap29Q9ERB0 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Snap29Q9ERB0 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Snap29Q9ERB0 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Snap29Q9ERB0 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Snap29Q9ERB0 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Snap29Q9ERB0 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Snap29Q9ERB0 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Snap29Q9ERB0 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Snap29Q9ERB0 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Snap29Q9ERB0 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Snap29Q9ERB0 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Snap29Q9ERB0 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Snap29Q9ERB0 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Snap29Q9ERB0 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Snap29Q9ERB0 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Snap29Q9ERB0 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Snap29Q9ERB0 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Snap29Q9ERB0 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Snap29Q9ERB0 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Snap29Q9ERB0 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Snap29Q9ERB0 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Snap29Q9ERB0 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Snap29Q9ERB0 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Snap29Q9ERB0 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Snap29Q9ERB0 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Snap29Q9ERB0 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Snap29Q9ERB0 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Snap29Q9ERB0 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Snap29Q9ERB0 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Snap29Q9ERB0 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Snap29Q9ERB0 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Snap29Q9ERB0 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Snap29Q9ERB0 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Snap29Q9ERB0 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Snap29Q9ERB0 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Snap29Q9ERB0 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Snap29Q9ERB0 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Snap29Q9ERB0 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Snap29Q9ERB0 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Snap29Q9ERB0 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Snap29Q9ERB0 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Snap29Q9ERB0 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Snap29Q9ERB0 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Snap29Q9ERB0 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Snap29Q9ERB0 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Snap29Q9ERB0 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Snap29Q9ERB0 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Snap29Q9ERB0 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Snap29Q9ERB0 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Snap29Q9ERB0 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Snap29Q9ERB0 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Snap29Q9ERB0 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Snap29Q9ERB0 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Snap29Q9ERB0 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Snap29Q9ERB0 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Snap29Q9ERB0 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Snap29Q9ERB0 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Snap29Q9ERB0 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Snap29Q9ERB0 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Snap29Q9ERB0 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Snap29Q9ERB0 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Snap29Q9ERB0 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Snap29Q9ERB0 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Snap29Q9ERB0 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Snap29Q9ERB0 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Snap29Q9ERB0 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Snap29Q9ERB0 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Snap29Q9ERB0 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Snap29Q9ERB0 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Snap29Q9ERB0 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Snap29Q9ERB0 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Snap29Q9ERB0 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Snap29Q9ERB0 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Snap29Q9ERB0 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Snap29Q9ERB0 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Snap29Q9ERB0 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Snap29Q9ERB0 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Snap29Q9ERB0 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Snap29Q9ERB0 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Snap29Q9ERB0 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Snap29Q9ERB0 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Snap29Q9ERB0 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Snap29Q9ERB0 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Snap29Q9ERB0 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Snap29Q9ERB0 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Snap29Q9ERB0 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Snap29Q9ERB0 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Snap29Q9ERB0 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Snap29Q9ERB0 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.8 ms