Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER63

Tnfrsf23, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 23, mousemouse

Predictions only

Length 176 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfrsf23Q9ER63 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tnfrsf23Q9ER63 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tnfrsf23Q9ER63 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tnfrsf23Q9ER63 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tnfrsf23Q9ER63 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tnfrsf23Q9ER63 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tnfrsf23Q9ER63 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tnfrsf23Q9ER63 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tnfrsf23Q9ER63 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tnfrsf23Q9ER63 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tnfrsf23Q9ER63 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tnfrsf23Q9ER63 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tnfrsf23Q9ER63 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tnfrsf23Q9ER63 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tnfrsf23Q9ER63 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tnfrsf23Q9ER63 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tnfrsf23Q9ER63 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tnfrsf23Q9ER63 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tnfrsf23Q9ER63 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tnfrsf23Q9ER63 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tnfrsf23Q9ER63 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tnfrsf23Q9ER63 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tnfrsf23Q9ER63 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Tnfrsf23Q9ER63 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tnfrsf23Q9ER63 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tnfrsf23Q9ER63 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tnfrsf23Q9ER63 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tnfrsf23Q9ER63 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tnfrsf23Q9ER63 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Tnfrsf23Q9ER63 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tnfrsf23Q9ER63 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Tnfrsf23Q9ER63 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tnfrsf23Q9ER63 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tnfrsf23Q9ER63 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tnfrsf23Q9ER63 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tnfrsf23Q9ER63 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tnfrsf23Q9ER63 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tnfrsf23Q9ER63 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tnfrsf23Q9ER63 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tnfrsf23Q9ER63 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tnfrsf23Q9ER63 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tnfrsf23Q9ER63 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tnfrsf23Q9ER63 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tnfrsf23Q9ER63 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tnfrsf23Q9ER63 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Tnfrsf23Q9ER63 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tnfrsf23Q9ER63 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tnfrsf23Q9ER63 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tnfrsf23Q9ER63 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tnfrsf23Q9ER63 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Tnfrsf23Q9ER63 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tnfrsf23Q9ER63 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tnfrsf23Q9ER63 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tnfrsf23Q9ER63 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tnfrsf23Q9ER63 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tnfrsf23Q9ER63 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tnfrsf23Q9ER63 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tnfrsf23Q9ER63 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tnfrsf23Q9ER63 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tnfrsf23Q9ER63 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tnfrsf23Q9ER63 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tnfrsf23Q9ER63 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tnfrsf23Q9ER63 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tnfrsf23Q9ER63 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tnfrsf23Q9ER63 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tnfrsf23Q9ER63 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tnfrsf23Q9ER63 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Tnfrsf23Q9ER63 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tnfrsf23Q9ER63 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tnfrsf23Q9ER63 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tnfrsf23Q9ER63 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tnfrsf23Q9ER63 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tnfrsf23Q9ER63 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tnfrsf23Q9ER63 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tnfrsf23Q9ER63 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Tnfrsf23Q9ER63 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tnfrsf23Q9ER63 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tnfrsf23Q9ER63 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tnfrsf23Q9ER63 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tnfrsf23Q9ER63 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tnfrsf23Q9ER63 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tnfrsf23Q9ER63 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tnfrsf23Q9ER63 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tnfrsf23Q9ER63 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tnfrsf23Q9ER63 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tnfrsf23Q9ER63 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tnfrsf23Q9ER63 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Tnfrsf23Q9ER63 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tnfrsf23Q9ER63 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tnfrsf23Q9ER63 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tnfrsf23Q9ER63 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Tnfrsf23Q9ER63 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tnfrsf23Q9ER63 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tnfrsf23Q9ER63 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tnfrsf23Q9ER63 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tnfrsf23Q9ER63 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tnfrsf23Q9ER63 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tnfrsf23Q9ER63 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tnfrsf23Q9ER63 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tnfrsf23Q9ER63 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms