Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQI8

Mrpl46, 39S ribosomal protein L46, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 283 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl46Q9EQI8 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Mrpl46Q9EQI8 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Mrpl46Q9EQI8 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Mrpl46Q9EQI8 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Mrpl46Q9EQI8 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Mrpl46Q9EQI8 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Mrpl46Q9EQI8 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Mrpl46Q9EQI8 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Mrpl46Q9EQI8 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Mrpl46Q9EQI8 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Mrpl46Q9EQI8 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Mrpl46Q9EQI8 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Mrpl46Q9EQI8 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Mrpl46Q9EQI8 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Mrpl46Q9EQI8 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Mrpl46Q9EQI8 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Mrpl46Q9EQI8 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Mrpl46Q9EQI8 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Mrpl46Q9EQI8 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Mrpl46Q9EQI8 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Mrpl46Q9EQI8 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Mrpl46Q9EQI8 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Mrpl46Q9EQI8 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Mrpl46Q9EQI8 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Mrpl46Q9EQI8 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Mrpl46Q9EQI8 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Mrpl46Q9EQI8 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Mrpl46Q9EQI8 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Mrpl46Q9EQI8 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Mrpl46Q9EQI8 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Mrpl46Q9EQI8 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Mrpl46Q9EQI8 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Mrpl46Q9EQI8 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Mrpl46Q9EQI8 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Mrpl46Q9EQI8 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Mrpl46Q9EQI8 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Mrpl46Q9EQI8 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Mrpl46Q9EQI8 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Mrpl46Q9EQI8 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Mrpl46Q9EQI8 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Mrpl46Q9EQI8 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Mrpl46Q9EQI8 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Mrpl46Q9EQI8 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Mrpl46Q9EQI8 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Mrpl46Q9EQI8 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Mrpl46Q9EQI8 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Mrpl46Q9EQI8 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Mrpl46Q9EQI8 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Mrpl46Q9EQI8 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Mrpl46Q9EQI8 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Mrpl46Q9EQI8 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Mrpl46Q9EQI8 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Mrpl46Q9EQI8 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Mrpl46Q9EQI8 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Mrpl46Q9EQI8 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Mrpl46Q9EQI8 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Mrpl46Q9EQI8 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Mrpl46Q9EQI8 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
Mrpl46Q9EQI8 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Mrpl46Q9EQI8 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Mrpl46Q9EQI8 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Mrpl46Q9EQI8 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Mrpl46Q9EQI8 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Mrpl46Q9EQI8 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Mrpl46Q9EQI8 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Mrpl46Q9EQI8 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Mrpl46Q9EQI8 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Mrpl46Q9EQI8 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Mrpl46Q9EQI8 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Mrpl46Q9EQI8 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Mrpl46Q9EQI8 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Mrpl46Q9EQI8 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Mrpl46Q9EQI8 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Mrpl46Q9EQI8 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Mrpl46Q9EQI8 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Mrpl46Q9EQI8 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Mrpl46Q9EQI8 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Mrpl46Q9EQI8 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Mrpl46Q9EQI8 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Mrpl46Q9EQI8 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Mrpl46Q9EQI8 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Mrpl46Q9EQI8 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Mrpl46Q9EQI8 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Mrpl46Q9EQI8 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Mrpl46Q9EQI8 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Mrpl46Q9EQI8 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Mrpl46Q9EQI8 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Mrpl46Q9EQI8 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Mrpl46Q9EQI8 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Mrpl46Q9EQI8 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Mrpl46Q9EQI8 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Mrpl46Q9EQI8 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Mrpl46Q9EQI8 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Mrpl46Q9EQI8 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Mrpl46Q9EQI8 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Mrpl46Q9EQI8 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Mrpl46Q9EQI8 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Mrpl46Q9EQI8 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Mrpl46Q9EQI8 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Mrpl46Q9EQI8 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.2 ms