Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQC0

Chst1, Carbohydrate sulfotransferase 1, mousemouse

Predictions only

Length 411 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chst1Q9EQC0 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Chst1Q9EQC0 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Chst1Q9EQC0 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Chst1Q9EQC0 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Chst1Q9EQC0 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Chst1Q9EQC0 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Chst1Q9EQC0 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Chst1Q9EQC0 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Chst1Q9EQC0 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Chst1Q9EQC0 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Chst1Q9EQC0 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Chst1Q9EQC0 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Chst1Q9EQC0 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Chst1Q9EQC0 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Chst1Q9EQC0 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Chst1Q9EQC0 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Chst1Q9EQC0 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Chst1Q9EQC0 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Chst1Q9EQC0 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Chst1Q9EQC0 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Chst1Q9EQC0 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Chst1Q9EQC0 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Chst1Q9EQC0 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Chst1Q9EQC0 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Chst1Q9EQC0 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Chst1Q9EQC0 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Chst1Q9EQC0 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Chst1Q9EQC0 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Chst1Q9EQC0 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Chst1Q9EQC0 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Chst1Q9EQC0 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Chst1Q9EQC0 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Chst1Q9EQC0 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Chst1Q9EQC0 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Chst1Q9EQC0 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Chst1Q9EQC0 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Chst1Q9EQC0 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Chst1Q9EQC0 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Chst1Q9EQC0 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Chst1Q9EQC0 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Chst1Q9EQC0 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Chst1Q9EQC0 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Chst1Q9EQC0 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Chst1Q9EQC0 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Chst1Q9EQC0 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Chst1Q9EQC0 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Chst1Q9EQC0 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Chst1Q9EQC0 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Chst1Q9EQC0 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Chst1Q9EQC0 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Chst1Q9EQC0 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Chst1Q9EQC0 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Chst1Q9EQC0 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Chst1Q9EQC0 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Chst1Q9EQC0 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Chst1Q9EQC0 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Chst1Q9EQC0 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Chst1Q9EQC0 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Chst1Q9EQC0 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Chst1Q9EQC0 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Chst1Q9EQC0 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Chst1Q9EQC0 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Chst1Q9EQC0 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Chst1Q9EQC0 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Chst1Q9EQC0 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Chst1Q9EQC0 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Chst1Q9EQC0 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Chst1Q9EQC0 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Chst1Q9EQC0 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Chst1Q9EQC0 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Chst1Q9EQC0 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Chst1Q9EQC0 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Chst1Q9EQC0 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Chst1Q9EQC0 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Chst1Q9EQC0 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Chst1Q9EQC0 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Chst1Q9EQC0 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Chst1Q9EQC0 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Chst1Q9EQC0 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Chst1Q9EQC0 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Chst1Q9EQC0 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Chst1Q9EQC0 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Chst1Q9EQC0 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Chst1Q9EQC0 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Chst1Q9EQC0 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Chst1Q9EQC0 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Chst1Q9EQC0 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Chst1Q9EQC0 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Chst1Q9EQC0 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Chst1Q9EQC0 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Chst1Q9EQC0 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Chst1Q9EQC0 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Chst1Q9EQC0 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Chst1Q9EQC0 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Chst1Q9EQC0 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
Chst1Q9EQC0 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Chst1Q9EQC0 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Chst1Q9EQC0 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Chst1Q9EQC0 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC21■□□□□ 0.95
Chst1Q9EQC0 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.6 ms