Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPV7

9530002B09Rik, AUMP, mousemouse

Predictions only

Length 135 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
9530002B09RikQ9EPV7 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
9530002B09RikQ9EPV7 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
9530002B09RikQ9EPV7 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
9530002B09RikQ9EPV7 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
9530002B09RikQ9EPV7 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
9530002B09RikQ9EPV7 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
9530002B09RikQ9EPV7 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
9530002B09RikQ9EPV7 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
9530002B09RikQ9EPV7 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
9530002B09RikQ9EPV7 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
9530002B09RikQ9EPV7 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
9530002B09RikQ9EPV7 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
9530002B09RikQ9EPV7 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
9530002B09RikQ9EPV7 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
9530002B09RikQ9EPV7 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
9530002B09RikQ9EPV7 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
9530002B09RikQ9EPV7 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
9530002B09RikQ9EPV7 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
9530002B09RikQ9EPV7 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
9530002B09RikQ9EPV7 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
9530002B09RikQ9EPV7 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
9530002B09RikQ9EPV7 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
9530002B09RikQ9EPV7 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
9530002B09RikQ9EPV7 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
9530002B09RikQ9EPV7 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
9530002B09RikQ9EPV7 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
9530002B09RikQ9EPV7 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
9530002B09RikQ9EPV7 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
9530002B09RikQ9EPV7 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
9530002B09RikQ9EPV7 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
9530002B09RikQ9EPV7 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
9530002B09RikQ9EPV7 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
9530002B09RikQ9EPV7 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
9530002B09RikQ9EPV7 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
9530002B09RikQ9EPV7 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
9530002B09RikQ9EPV7 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
9530002B09RikQ9EPV7 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
9530002B09RikQ9EPV7 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
9530002B09RikQ9EPV7 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
9530002B09RikQ9EPV7 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
9530002B09RikQ9EPV7 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
9530002B09RikQ9EPV7 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
9530002B09RikQ9EPV7 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
9530002B09RikQ9EPV7 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
9530002B09RikQ9EPV7 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
9530002B09RikQ9EPV7 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.86
9530002B09RikQ9EPV7 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
9530002B09RikQ9EPV7 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
9530002B09RikQ9EPV7 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
9530002B09RikQ9EPV7 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
9530002B09RikQ9EPV7 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
9530002B09RikQ9EPV7 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
9530002B09RikQ9EPV7 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
9530002B09RikQ9EPV7 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
9530002B09RikQ9EPV7 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
9530002B09RikQ9EPV7 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
9530002B09RikQ9EPV7 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
9530002B09RikQ9EPV7 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
9530002B09RikQ9EPV7 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
9530002B09RikQ9EPV7 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
9530002B09RikQ9EPV7 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
9530002B09RikQ9EPV7 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
9530002B09RikQ9EPV7 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
9530002B09RikQ9EPV7 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
9530002B09RikQ9EPV7 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
9530002B09RikQ9EPV7 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
9530002B09RikQ9EPV7 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
9530002B09RikQ9EPV7 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
9530002B09RikQ9EPV7 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
9530002B09RikQ9EPV7 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
9530002B09RikQ9EPV7 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
9530002B09RikQ9EPV7 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
9530002B09RikQ9EPV7 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
9530002B09RikQ9EPV7 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
9530002B09RikQ9EPV7 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
9530002B09RikQ9EPV7 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
9530002B09RikQ9EPV7 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
9530002B09RikQ9EPV7 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
9530002B09RikQ9EPV7 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
9530002B09RikQ9EPV7 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
9530002B09RikQ9EPV7 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
9530002B09RikQ9EPV7 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
9530002B09RikQ9EPV7 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
9530002B09RikQ9EPV7 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
9530002B09RikQ9EPV7 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
9530002B09RikQ9EPV7 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
9530002B09RikQ9EPV7 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
9530002B09RikQ9EPV7 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
9530002B09RikQ9EPV7 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
9530002B09RikQ9EPV7 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
9530002B09RikQ9EPV7 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
9530002B09RikQ9EPV7 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
9530002B09RikQ9EPV7 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
9530002B09RikQ9EPV7 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
9530002B09RikQ9EPV7 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
9530002B09RikQ9EPV7 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
9530002B09RikQ9EPV7 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
9530002B09RikQ9EPV7 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
9530002B09RikQ9EPV7 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
9530002B09RikQ9EPV7 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.7 ms