Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPU5

Tnfrsf21, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 21, mousemouse

Predictions only

Length 655 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfrsf21Q9EPU5 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tnfrsf21Q9EPU5 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Tnfrsf21Q9EPU5 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tnfrsf21Q9EPU5 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tnfrsf21Q9EPU5 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tnfrsf21Q9EPU5 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tnfrsf21Q9EPU5 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tnfrsf21Q9EPU5 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tnfrsf21Q9EPU5 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tnfrsf21Q9EPU5 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tnfrsf21Q9EPU5 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tnfrsf21Q9EPU5 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Tnfrsf21Q9EPU5 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tnfrsf21Q9EPU5 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tnfrsf21Q9EPU5 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tnfrsf21Q9EPU5 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tnfrsf21Q9EPU5 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tnfrsf21Q9EPU5 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tnfrsf21Q9EPU5 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tnfrsf21Q9EPU5 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tnfrsf21Q9EPU5 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tnfrsf21Q9EPU5 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tnfrsf21Q9EPU5 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tnfrsf21Q9EPU5 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tnfrsf21Q9EPU5 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tnfrsf21Q9EPU5 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tnfrsf21Q9EPU5 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tnfrsf21Q9EPU5 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Tnfrsf21Q9EPU5 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tnfrsf21Q9EPU5 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tnfrsf21Q9EPU5 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tnfrsf21Q9EPU5 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tnfrsf21Q9EPU5 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tnfrsf21Q9EPU5 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tnfrsf21Q9EPU5 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tnfrsf21Q9EPU5 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tnfrsf21Q9EPU5 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tnfrsf21Q9EPU5 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tnfrsf21Q9EPU5 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tnfrsf21Q9EPU5 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tnfrsf21Q9EPU5 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tnfrsf21Q9EPU5 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tnfrsf21Q9EPU5 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tnfrsf21Q9EPU5 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Tnfrsf21Q9EPU5 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tnfrsf21Q9EPU5 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tnfrsf21Q9EPU5 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tnfrsf21Q9EPU5 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tnfrsf21Q9EPU5 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tnfrsf21Q9EPU5 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tnfrsf21Q9EPU5 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tnfrsf21Q9EPU5 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Tnfrsf21Q9EPU5 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Tnfrsf21Q9EPU5 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tnfrsf21Q9EPU5 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tnfrsf21Q9EPU5 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tnfrsf21Q9EPU5 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tnfrsf21Q9EPU5 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Tnfrsf21Q9EPU5 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Tnfrsf21Q9EPU5 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Tnfrsf21Q9EPU5 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Tnfrsf21Q9EPU5 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Tnfrsf21Q9EPU5 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Tnfrsf21Q9EPU5 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Tnfrsf21Q9EPU5 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tnfrsf21Q9EPU5 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tnfrsf21Q9EPU5 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tnfrsf21Q9EPU5 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tnfrsf21Q9EPU5 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tnfrsf21Q9EPU5 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tnfrsf21Q9EPU5 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tnfrsf21Q9EPU5 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tnfrsf21Q9EPU5 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tnfrsf21Q9EPU5 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Tnfrsf21Q9EPU5 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tnfrsf21Q9EPU5 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Tnfrsf21Q9EPU5 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tnfrsf21Q9EPU5 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tnfrsf21Q9EPU5 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tnfrsf21Q9EPU5 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tnfrsf21Q9EPU5 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Tnfrsf21Q9EPU5 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tnfrsf21Q9EPU5 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tnfrsf21Q9EPU5 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tnfrsf21Q9EPU5 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tnfrsf21Q9EPU5 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tnfrsf21Q9EPU5 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tnfrsf21Q9EPU5 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tnfrsf21Q9EPU5 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tnfrsf21Q9EPU5 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tnfrsf21Q9EPU5 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tnfrsf21Q9EPU5 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tnfrsf21Q9EPU5 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tnfrsf21Q9EPU5 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tnfrsf21Q9EPU5 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tnfrsf21Q9EPU5 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tnfrsf21Q9EPU5 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tnfrsf21Q9EPU5 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tnfrsf21Q9EPU5 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tnfrsf21Q9EPU5 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.7 ms