Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPQ2

Rpgrip1, X-linked retinitis pigmentosa GTPase regulator-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC38.41■■■■□ 3.74
Rpgrip1Q9EPQ2 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC38.4■■■■□ 3.74
Rpgrip1Q9EPQ2 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.39■■■■□ 3.74
Rpgrip1Q9EPQ2 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC38.38■■■■□ 3.73
Rpgrip1Q9EPQ2 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.37■■■■□ 3.73
Rpgrip1Q9EPQ2 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.37■■■■□ 3.73
Rpgrip1Q9EPQ2 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.36■■■■□ 3.73
Rpgrip1Q9EPQ2 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.34■■■■□ 3.73
Rpgrip1Q9EPQ2 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC38.33■■■■□ 3.73
Rpgrip1Q9EPQ2 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC38.33■■■■□ 3.73
Rpgrip1Q9EPQ2 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC38.32■■■■□ 3.72
Rpgrip1Q9EPQ2 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC38.32■■■■□ 3.72
Rpgrip1Q9EPQ2 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.31■■■■□ 3.72
Rpgrip1Q9EPQ2 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC38.31■■■■□ 3.72
Rpgrip1Q9EPQ2 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.3■■■■□ 3.72
Rpgrip1Q9EPQ2 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC38.3■■■■□ 3.72
Rpgrip1Q9EPQ2 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.29■■■■□ 3.72
Rpgrip1Q9EPQ2 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.29■■■■□ 3.72
Rpgrip1Q9EPQ2 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC38.27■■■■□ 3.72
Rpgrip1Q9EPQ2 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.27■■■■□ 3.72
Rpgrip1Q9EPQ2 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.24■■■■□ 3.71
Rpgrip1Q9EPQ2 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.23■■■■□ 3.71
Rpgrip1Q9EPQ2 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.22■■■■□ 3.71
Rpgrip1Q9EPQ2 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC38.22■■■■□ 3.71
Rpgrip1Q9EPQ2 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.21■■■■□ 3.71
Rpgrip1Q9EPQ2 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.21■■■■□ 3.71
Rpgrip1Q9EPQ2 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.2■■■■□ 3.71
Rpgrip1Q9EPQ2 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.2■■■■□ 3.71
Rpgrip1Q9EPQ2 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.18■■■■□ 3.7
Rpgrip1Q9EPQ2 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC38.17■■■■□ 3.7
Rpgrip1Q9EPQ2 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC38.16■■■■□ 3.7
Rpgrip1Q9EPQ2 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.16■■■■□ 3.7
Rpgrip1Q9EPQ2 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC38.14■■■■□ 3.7
Rpgrip1Q9EPQ2 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.14■■■■□ 3.7
Rpgrip1Q9EPQ2 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.11■■■■□ 3.69
Rpgrip1Q9EPQ2 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC38.09■■■■□ 3.69
Rpgrip1Q9EPQ2 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.09■■■■□ 3.69
Rpgrip1Q9EPQ2 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC38.06■■■■□ 3.68
Rpgrip1Q9EPQ2 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.05■■■■□ 3.68
Rpgrip1Q9EPQ2 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.05■■■■□ 3.68
Rpgrip1Q9EPQ2 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.05■■■■□ 3.68
Rpgrip1Q9EPQ2 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC38.04■■■■□ 3.68
Rpgrip1Q9EPQ2 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC38.04■■■■□ 3.68
Rpgrip1Q9EPQ2 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.03■■■■□ 3.68
Rpgrip1Q9EPQ2 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.02■■■■□ 3.68
Rpgrip1Q9EPQ2 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC38.02■■■■□ 3.68
Rpgrip1Q9EPQ2 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.02■■■■□ 3.68
Rpgrip1Q9EPQ2 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.01■■■■□ 3.68
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC38.01■■■■□ 3.68
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC38.01■■■■□ 3.68
Rpgrip1Q9EPQ2 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38■■■■□ 3.67
Rpgrip1Q9EPQ2 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC38■■■■□ 3.67
Rpgrip1Q9EPQ2 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC37.99■■■■□ 3.67
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC37.98■■■■□ 3.67
Rpgrip1Q9EPQ2 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.98■■■■□ 3.67
Rpgrip1Q9EPQ2 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC37.97■■■■□ 3.67
Rpgrip1Q9EPQ2 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.97■■■■□ 3.67
Rpgrip1Q9EPQ2 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.96■■■■□ 3.67
Rpgrip1Q9EPQ2 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.95■■■■□ 3.67
Rpgrip1Q9EPQ2 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.94■■■■□ 3.66
Rpgrip1Q9EPQ2 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.94■■■■□ 3.66
Rpgrip1Q9EPQ2 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.94■■■■□ 3.66
Rpgrip1Q9EPQ2 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.93■■■■□ 3.66
Rpgrip1Q9EPQ2 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.93■■■■□ 3.66
Rpgrip1Q9EPQ2 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC37.93■■■■□ 3.66
Rpgrip1Q9EPQ2 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.92■■■■□ 3.66
Rpgrip1Q9EPQ2 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.91■■■■□ 3.66
Rpgrip1Q9EPQ2 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.91■■■■□ 3.66
Rpgrip1Q9EPQ2 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.88■■■■□ 3.66
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC37.88■■■■□ 3.66
Rpgrip1Q9EPQ2 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC37.88■■■■□ 3.65
Rpgrip1Q9EPQ2 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.87■■■■□ 3.65
Rpgrip1Q9EPQ2 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC37.86■■■■□ 3.65
Rpgrip1Q9EPQ2 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.85■■■■□ 3.65
Rpgrip1Q9EPQ2 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC37.82■■■■□ 3.65
Rpgrip1Q9EPQ2 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.82■■■■□ 3.65
Rpgrip1Q9EPQ2 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.82■■■■□ 3.64
Rpgrip1Q9EPQ2 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC37.82■■■■□ 3.64
Rpgrip1Q9EPQ2 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.81■■■■□ 3.64
Rpgrip1Q9EPQ2 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.8■■■■□ 3.64
Rpgrip1Q9EPQ2 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.8■■■■□ 3.64
Rpgrip1Q9EPQ2 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.79■■■■□ 3.64
Rpgrip1Q9EPQ2 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC37.78■■■■□ 3.64
Rpgrip1Q9EPQ2 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC37.78■■■■□ 3.64
Rpgrip1Q9EPQ2 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC37.78■■■■□ 3.64
Rpgrip1Q9EPQ2 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC37.78■■■■□ 3.64
Rpgrip1Q9EPQ2 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.77■■■■□ 3.64
Rpgrip1Q9EPQ2 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.77■■■■□ 3.64
Rpgrip1Q9EPQ2 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC37.76■■■■□ 3.64
Rpgrip1Q9EPQ2 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC37.75■■■■□ 3.63
Rpgrip1Q9EPQ2 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC37.74■■■■□ 3.63
Rpgrip1Q9EPQ2 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.73■■■■□ 3.63
Rpgrip1Q9EPQ2 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.73■■■■□ 3.63
Rpgrip1Q9EPQ2 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.71■■■■□ 3.63
Rpgrip1Q9EPQ2 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.71■■■■□ 3.63
Rpgrip1Q9EPQ2 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC37.71■■■■□ 3.63
Rpgrip1Q9EPQ2 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.69■■■■□ 3.62
Rpgrip1Q9EPQ2 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.68■■■■□ 3.62
Rpgrip1Q9EPQ2 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.67■■■■□ 3.62
Rpgrip1Q9EPQ2 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.64■■■■□ 3.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38 ms