Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPL6

Mmp1b, Interstitial collagenase B, mousemouse

Predictions only

Length 463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mmp1bQ9EPL6 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Mmp1bQ9EPL6 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Mmp1bQ9EPL6 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Mmp1bQ9EPL6 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Mmp1bQ9EPL6 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Mmp1bQ9EPL6 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Mmp1bQ9EPL6 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Mmp1bQ9EPL6 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Mmp1bQ9EPL6 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Mmp1bQ9EPL6 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Mmp1bQ9EPL6 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Mmp1bQ9EPL6 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Mmp1bQ9EPL6 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Mmp1bQ9EPL6 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Mmp1bQ9EPL6 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Mmp1bQ9EPL6 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Mmp1bQ9EPL6 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Mmp1bQ9EPL6 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Mmp1bQ9EPL6 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Mmp1bQ9EPL6 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Mmp1bQ9EPL6 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Mmp1bQ9EPL6 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Mmp1bQ9EPL6 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Mmp1bQ9EPL6 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Mmp1bQ9EPL6 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Mmp1bQ9EPL6 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Mmp1bQ9EPL6 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Mmp1bQ9EPL6 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Mmp1bQ9EPL6 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Mmp1bQ9EPL6 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Mmp1bQ9EPL6 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Mmp1bQ9EPL6 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Mmp1bQ9EPL6 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Mmp1bQ9EPL6 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Mmp1bQ9EPL6 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Mmp1bQ9EPL6 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Mmp1bQ9EPL6 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Mmp1bQ9EPL6 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Mmp1bQ9EPL6 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Mmp1bQ9EPL6 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Mmp1bQ9EPL6 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Mmp1bQ9EPL6 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Mmp1bQ9EPL6 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Mmp1bQ9EPL6 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Mmp1bQ9EPL6 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Mmp1bQ9EPL6 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Mmp1bQ9EPL6 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Mmp1bQ9EPL6 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Mmp1bQ9EPL6 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Mmp1bQ9EPL6 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Mmp1bQ9EPL6 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Mmp1bQ9EPL6 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Mmp1bQ9EPL6 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Mmp1bQ9EPL6 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Mmp1bQ9EPL6 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Mmp1bQ9EPL6 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Mmp1bQ9EPL6 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Mmp1bQ9EPL6 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Mmp1bQ9EPL6 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Mmp1bQ9EPL6 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Mmp1bQ9EPL6 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Mmp1bQ9EPL6 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Mmp1bQ9EPL6 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Mmp1bQ9EPL6 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Mmp1bQ9EPL6 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Mmp1bQ9EPL6 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Mmp1bQ9EPL6 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Mmp1bQ9EPL6 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Mmp1bQ9EPL6 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Mmp1bQ9EPL6 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Mmp1bQ9EPL6 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Mmp1bQ9EPL6 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Mmp1bQ9EPL6 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Mmp1bQ9EPL6 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Mmp1bQ9EPL6 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Mmp1bQ9EPL6 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Mmp1bQ9EPL6 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Mmp1bQ9EPL6 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Mmp1bQ9EPL6 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Mmp1bQ9EPL6 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Mmp1bQ9EPL6 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Mmp1bQ9EPL6 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Mmp1bQ9EPL6 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Mmp1bQ9EPL6 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Mmp1bQ9EPL6 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Mmp1bQ9EPL6 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Mmp1bQ9EPL6 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Mmp1bQ9EPL6 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Mmp1bQ9EPL6 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Mmp1bQ9EPL6 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Mmp1bQ9EPL6 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Mmp1bQ9EPL6 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Mmp1bQ9EPL6 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Mmp1bQ9EPL6 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Mmp1bQ9EPL6 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Mmp1bQ9EPL6 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Mmp1bQ9EPL6 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Mmp1bQ9EPL6 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Mmp1bQ9EPL6 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Mmp1bQ9EPL6 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.29■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms