Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCR2

Ap3s1, AP-3 complex subunit sigma-1, mousemouse

Predictions only

Length 193 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ap3s1Q9DCR2 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ap3s1Q9DCR2 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ap3s1Q9DCR2 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ap3s1Q9DCR2 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ap3s1Q9DCR2 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ap3s1Q9DCR2 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ap3s1Q9DCR2 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ap3s1Q9DCR2 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ap3s1Q9DCR2 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ap3s1Q9DCR2 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ap3s1Q9DCR2 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ap3s1Q9DCR2 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Ap3s1Q9DCR2 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ap3s1Q9DCR2 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ap3s1Q9DCR2 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ap3s1Q9DCR2 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ap3s1Q9DCR2 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ap3s1Q9DCR2 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ap3s1Q9DCR2 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ap3s1Q9DCR2 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ap3s1Q9DCR2 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Ap3s1Q9DCR2 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ap3s1Q9DCR2 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ap3s1Q9DCR2 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ap3s1Q9DCR2 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ap3s1Q9DCR2 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ap3s1Q9DCR2 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ap3s1Q9DCR2 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ap3s1Q9DCR2 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ap3s1Q9DCR2 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ap3s1Q9DCR2 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ap3s1Q9DCR2 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ap3s1Q9DCR2 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ap3s1Q9DCR2 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ap3s1Q9DCR2 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ap3s1Q9DCR2 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ap3s1Q9DCR2 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ap3s1Q9DCR2 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ap3s1Q9DCR2 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ap3s1Q9DCR2 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ap3s1Q9DCR2 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ap3s1Q9DCR2 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ap3s1Q9DCR2 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ap3s1Q9DCR2 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ap3s1Q9DCR2 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ap3s1Q9DCR2 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ap3s1Q9DCR2 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ap3s1Q9DCR2 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ap3s1Q9DCR2 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ap3s1Q9DCR2 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ap3s1Q9DCR2 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Ap3s1Q9DCR2 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ap3s1Q9DCR2 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ap3s1Q9DCR2 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ap3s1Q9DCR2 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ap3s1Q9DCR2 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ap3s1Q9DCR2 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ap3s1Q9DCR2 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ap3s1Q9DCR2 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ap3s1Q9DCR2 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ap3s1Q9DCR2 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ap3s1Q9DCR2 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ap3s1Q9DCR2 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ap3s1Q9DCR2 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ap3s1Q9DCR2 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ap3s1Q9DCR2 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ap3s1Q9DCR2 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ap3s1Q9DCR2 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ap3s1Q9DCR2 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ap3s1Q9DCR2 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Ap3s1Q9DCR2 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ap3s1Q9DCR2 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ap3s1Q9DCR2 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ap3s1Q9DCR2 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ap3s1Q9DCR2 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ap3s1Q9DCR2 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ap3s1Q9DCR2 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ap3s1Q9DCR2 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ap3s1Q9DCR2 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ap3s1Q9DCR2 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Ap3s1Q9DCR2 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Ap3s1Q9DCR2 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ap3s1Q9DCR2 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Ap3s1Q9DCR2 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ap3s1Q9DCR2 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ap3s1Q9DCR2 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ap3s1Q9DCR2 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ap3s1Q9DCR2 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ap3s1Q9DCR2 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ap3s1Q9DCR2 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ap3s1Q9DCR2 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Ap3s1Q9DCR2 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ap3s1Q9DCR2 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ap3s1Q9DCR2 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ap3s1Q9DCR2 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ap3s1Q9DCR2 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ap3s1Q9DCR2 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ap3s1Q9DCR2 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ap3s1Q9DCR2 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ap3s1Q9DCR2 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.2 ms