Protein–RNA interactions for Protein: Q9DC61

Pmpca, Mitochondrial-processing peptidase subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 524 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PmpcaQ9DC61 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PmpcaQ9DC61 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PmpcaQ9DC61 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PmpcaQ9DC61 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PmpcaQ9DC61 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PmpcaQ9DC61 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PmpcaQ9DC61 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PmpcaQ9DC61 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PmpcaQ9DC61 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PmpcaQ9DC61 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PmpcaQ9DC61 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PmpcaQ9DC61 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
PmpcaQ9DC61 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PmpcaQ9DC61 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PmpcaQ9DC61 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PmpcaQ9DC61 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PmpcaQ9DC61 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PmpcaQ9DC61 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PmpcaQ9DC61 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PmpcaQ9DC61 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PmpcaQ9DC61 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PmpcaQ9DC61 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PmpcaQ9DC61 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PmpcaQ9DC61 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PmpcaQ9DC61 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PmpcaQ9DC61 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PmpcaQ9DC61 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PmpcaQ9DC61 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PmpcaQ9DC61 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PmpcaQ9DC61 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
PmpcaQ9DC61 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PmpcaQ9DC61 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PmpcaQ9DC61 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PmpcaQ9DC61 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PmpcaQ9DC61 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PmpcaQ9DC61 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PmpcaQ9DC61 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PmpcaQ9DC61 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PmpcaQ9DC61 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PmpcaQ9DC61 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PmpcaQ9DC61 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PmpcaQ9DC61 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PmpcaQ9DC61 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PmpcaQ9DC61 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
PmpcaQ9DC61 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PmpcaQ9DC61 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PmpcaQ9DC61 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PmpcaQ9DC61 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PmpcaQ9DC61 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PmpcaQ9DC61 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PmpcaQ9DC61 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PmpcaQ9DC61 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PmpcaQ9DC61 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PmpcaQ9DC61 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PmpcaQ9DC61 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PmpcaQ9DC61 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PmpcaQ9DC61 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PmpcaQ9DC61 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PmpcaQ9DC61 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PmpcaQ9DC61 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
PmpcaQ9DC61 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PmpcaQ9DC61 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PmpcaQ9DC61 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PmpcaQ9DC61 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PmpcaQ9DC61 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PmpcaQ9DC61 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
PmpcaQ9DC61 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PmpcaQ9DC61 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PmpcaQ9DC61 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PmpcaQ9DC61 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
PmpcaQ9DC61 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PmpcaQ9DC61 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PmpcaQ9DC61 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PmpcaQ9DC61 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PmpcaQ9DC61 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PmpcaQ9DC61 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PmpcaQ9DC61 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PmpcaQ9DC61 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PmpcaQ9DC61 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PmpcaQ9DC61 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PmpcaQ9DC61 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PmpcaQ9DC61 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PmpcaQ9DC61 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PmpcaQ9DC61 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PmpcaQ9DC61 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PmpcaQ9DC61 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PmpcaQ9DC61 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PmpcaQ9DC61 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PmpcaQ9DC61 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PmpcaQ9DC61 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PmpcaQ9DC61 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PmpcaQ9DC61 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PmpcaQ9DC61 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PmpcaQ9DC61 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PmpcaQ9DC61 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PmpcaQ9DC61 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PmpcaQ9DC61 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PmpcaQ9DC61 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PmpcaQ9DC61 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PmpcaQ9DC61 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.7 ms