Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBU0

Tm9sf1, Transmembrane 9 superfamily member 1, mousemouse

Predictions only

Length 606 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tm9sf1Q9DBU0 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Tm9sf1Q9DBU0 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Tm9sf1Q9DBU0 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Tm9sf1Q9DBU0 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Tm9sf1Q9DBU0 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Tm9sf1Q9DBU0 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC24.7■■□□□ 1.55
Tm9sf1Q9DBU0 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Tm9sf1Q9DBU0 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Tm9sf1Q9DBU0 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Tm9sf1Q9DBU0 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Tm9sf1Q9DBU0 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Tm9sf1Q9DBU0 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Tm9sf1Q9DBU0 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Tm9sf1Q9DBU0 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Tm9sf1Q9DBU0 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Tm9sf1Q9DBU0 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Tm9sf1Q9DBU0 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Tm9sf1Q9DBU0 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Tm9sf1Q9DBU0 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
Tm9sf1Q9DBU0 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Tm9sf1Q9DBU0 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Tm9sf1Q9DBU0 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Tm9sf1Q9DBU0 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Tm9sf1Q9DBU0 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Tm9sf1Q9DBU0 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Tm9sf1Q9DBU0 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Tm9sf1Q9DBU0 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Tm9sf1Q9DBU0 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Tm9sf1Q9DBU0 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Tm9sf1Q9DBU0 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Tm9sf1Q9DBU0 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Tm9sf1Q9DBU0 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Tm9sf1Q9DBU0 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Tm9sf1Q9DBU0 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Tm9sf1Q9DBU0 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Tm9sf1Q9DBU0 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
Tm9sf1Q9DBU0 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Tm9sf1Q9DBU0 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Tm9sf1Q9DBU0 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Tm9sf1Q9DBU0 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Tm9sf1Q9DBU0 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Tm9sf1Q9DBU0 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Tm9sf1Q9DBU0 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Tm9sf1Q9DBU0 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Tm9sf1Q9DBU0 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Tm9sf1Q9DBU0 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Tm9sf1Q9DBU0 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Tm9sf1Q9DBU0 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Tm9sf1Q9DBU0 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Tm9sf1Q9DBU0 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Tm9sf1Q9DBU0 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Tm9sf1Q9DBU0 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Tm9sf1Q9DBU0 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Tm9sf1Q9DBU0 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Tm9sf1Q9DBU0 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Tm9sf1Q9DBU0 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Tm9sf1Q9DBU0 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Tm9sf1Q9DBU0 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Tm9sf1Q9DBU0 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Tm9sf1Q9DBU0 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Tm9sf1Q9DBU0 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Tm9sf1Q9DBU0 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Tm9sf1Q9DBU0 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Tm9sf1Q9DBU0 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Tm9sf1Q9DBU0 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Tm9sf1Q9DBU0 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Tm9sf1Q9DBU0 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Tm9sf1Q9DBU0 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Tm9sf1Q9DBU0 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Tm9sf1Q9DBU0 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Tm9sf1Q9DBU0 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Tm9sf1Q9DBU0 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Tm9sf1Q9DBU0 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Tm9sf1Q9DBU0 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Tm9sf1Q9DBU0 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Tm9sf1Q9DBU0 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Tm9sf1Q9DBU0 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Tm9sf1Q9DBU0 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Tm9sf1Q9DBU0 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Tm9sf1Q9DBU0 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Tm9sf1Q9DBU0 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Tm9sf1Q9DBU0 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Tm9sf1Q9DBU0 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Tm9sf1Q9DBU0 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Tm9sf1Q9DBU0 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Tm9sf1Q9DBU0 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Tm9sf1Q9DBU0 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Tm9sf1Q9DBU0 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Tm9sf1Q9DBU0 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Tm9sf1Q9DBU0 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Tm9sf1Q9DBU0 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Tm9sf1Q9DBU0 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Tm9sf1Q9DBU0 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Tm9sf1Q9DBU0 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Tm9sf1Q9DBU0 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Tm9sf1Q9DBU0 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Tm9sf1Q9DBU0 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Tm9sf1Q9DBU0 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Tm9sf1Q9DBU0 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Tm9sf1Q9DBU0 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
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