Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBN9

Ddx59, Probable ATP-dependent RNA helicase DDX59, mousemouse

Predictions only

Length 619 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddx59Q9DBN9 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ddx59Q9DBN9 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ddx59Q9DBN9 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ddx59Q9DBN9 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ddx59Q9DBN9 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ddx59Q9DBN9 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ddx59Q9DBN9 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ddx59Q9DBN9 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ddx59Q9DBN9 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ddx59Q9DBN9 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ddx59Q9DBN9 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Ddx59Q9DBN9 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ddx59Q9DBN9 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ddx59Q9DBN9 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ddx59Q9DBN9 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Ddx59Q9DBN9 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ddx59Q9DBN9 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ddx59Q9DBN9 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ddx59Q9DBN9 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ddx59Q9DBN9 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Ddx59Q9DBN9 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ddx59Q9DBN9 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ddx59Q9DBN9 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ddx59Q9DBN9 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ddx59Q9DBN9 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ddx59Q9DBN9 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ddx59Q9DBN9 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ddx59Q9DBN9 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ddx59Q9DBN9 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ddx59Q9DBN9 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ddx59Q9DBN9 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ddx59Q9DBN9 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ddx59Q9DBN9 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ddx59Q9DBN9 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Ddx59Q9DBN9 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ddx59Q9DBN9 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Ddx59Q9DBN9 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ddx59Q9DBN9 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ddx59Q9DBN9 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ddx59Q9DBN9 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ddx59Q9DBN9 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ddx59Q9DBN9 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ddx59Q9DBN9 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ddx59Q9DBN9 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ddx59Q9DBN9 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ddx59Q9DBN9 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ddx59Q9DBN9 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ddx59Q9DBN9 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ddx59Q9DBN9 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ddx59Q9DBN9 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ddx59Q9DBN9 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ddx59Q9DBN9 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ddx59Q9DBN9 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Ddx59Q9DBN9 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ddx59Q9DBN9 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ddx59Q9DBN9 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ddx59Q9DBN9 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ddx59Q9DBN9 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ddx59Q9DBN9 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ddx59Q9DBN9 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ddx59Q9DBN9 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ddx59Q9DBN9 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ddx59Q9DBN9 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ddx59Q9DBN9 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ddx59Q9DBN9 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ddx59Q9DBN9 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ddx59Q9DBN9 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ddx59Q9DBN9 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ddx59Q9DBN9 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ddx59Q9DBN9 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ddx59Q9DBN9 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ddx59Q9DBN9 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ddx59Q9DBN9 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ddx59Q9DBN9 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ddx59Q9DBN9 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ddx59Q9DBN9 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ddx59Q9DBN9 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Ddx59Q9DBN9 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Ddx59Q9DBN9 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ddx59Q9DBN9 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ddx59Q9DBN9 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ddx59Q9DBN9 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ddx59Q9DBN9 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ddx59Q9DBN9 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Ddx59Q9DBN9 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ddx59Q9DBN9 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ddx59Q9DBN9 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ddx59Q9DBN9 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ddx59Q9DBN9 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ddx59Q9DBN9 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ddx59Q9DBN9 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Ddx59Q9DBN9 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ddx59Q9DBN9 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Ddx59Q9DBN9 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ddx59Q9DBN9 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ddx59Q9DBN9 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Ddx59Q9DBN9 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ddx59Q9DBN9 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ddx59Q9DBN9 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ddx59Q9DBN9 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.4 ms