Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBA6

Tysnd1, Peroxisomal leader peptide-processing protease, mousemouse

Predictions only

Length 568 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tysnd1Q9DBA6 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tysnd1Q9DBA6 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tysnd1Q9DBA6 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tysnd1Q9DBA6 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tysnd1Q9DBA6 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tysnd1Q9DBA6 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tysnd1Q9DBA6 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tysnd1Q9DBA6 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tysnd1Q9DBA6 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tysnd1Q9DBA6 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Tysnd1Q9DBA6 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tysnd1Q9DBA6 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tysnd1Q9DBA6 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tysnd1Q9DBA6 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tysnd1Q9DBA6 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tysnd1Q9DBA6 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tysnd1Q9DBA6 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.15
Tysnd1Q9DBA6 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tysnd1Q9DBA6 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tysnd1Q9DBA6 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tysnd1Q9DBA6 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tysnd1Q9DBA6 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tysnd1Q9DBA6 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tysnd1Q9DBA6 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tysnd1Q9DBA6 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tysnd1Q9DBA6 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tysnd1Q9DBA6 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tysnd1Q9DBA6 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tysnd1Q9DBA6 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tysnd1Q9DBA6 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tysnd1Q9DBA6 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tysnd1Q9DBA6 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Tysnd1Q9DBA6 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tysnd1Q9DBA6 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tysnd1Q9DBA6 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tysnd1Q9DBA6 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tysnd1Q9DBA6 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tysnd1Q9DBA6 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tysnd1Q9DBA6 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tysnd1Q9DBA6 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tysnd1Q9DBA6 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tysnd1Q9DBA6 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tysnd1Q9DBA6 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tysnd1Q9DBA6 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tysnd1Q9DBA6 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tysnd1Q9DBA6 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tysnd1Q9DBA6 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tysnd1Q9DBA6 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tysnd1Q9DBA6 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tysnd1Q9DBA6 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tysnd1Q9DBA6 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Tysnd1Q9DBA6 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tysnd1Q9DBA6 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tysnd1Q9DBA6 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tysnd1Q9DBA6 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tysnd1Q9DBA6 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tysnd1Q9DBA6 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tysnd1Q9DBA6 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tysnd1Q9DBA6 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tysnd1Q9DBA6 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tysnd1Q9DBA6 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tysnd1Q9DBA6 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tysnd1Q9DBA6 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tysnd1Q9DBA6 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tysnd1Q9DBA6 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Tysnd1Q9DBA6 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tysnd1Q9DBA6 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tysnd1Q9DBA6 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tysnd1Q9DBA6 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tysnd1Q9DBA6 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tysnd1Q9DBA6 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tysnd1Q9DBA6 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tysnd1Q9DBA6 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Tysnd1Q9DBA6 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tysnd1Q9DBA6 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tysnd1Q9DBA6 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tysnd1Q9DBA6 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tysnd1Q9DBA6 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tysnd1Q9DBA6 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tysnd1Q9DBA6 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tysnd1Q9DBA6 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tysnd1Q9DBA6 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tysnd1Q9DBA6 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tysnd1Q9DBA6 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tysnd1Q9DBA6 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tysnd1Q9DBA6 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tysnd1Q9DBA6 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tysnd1Q9DBA6 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Tysnd1Q9DBA6 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Tysnd1Q9DBA6 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Tysnd1Q9DBA6 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tysnd1Q9DBA6 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tysnd1Q9DBA6 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tysnd1Q9DBA6 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tysnd1Q9DBA6 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Tysnd1Q9DBA6 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tysnd1Q9DBA6 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tysnd1Q9DBA6 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tysnd1Q9DBA6 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tysnd1Q9DBA6 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms