Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB34

Chmp2a, Charged multivesicular body protein 2a, mousemouse

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp2aQ9DB34 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Chmp2aQ9DB34 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Chmp2aQ9DB34 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Chmp2aQ9DB34 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Chmp2aQ9DB34 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Chmp2aQ9DB34 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Chmp2aQ9DB34 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Chmp2aQ9DB34 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Chmp2aQ9DB34 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Chmp2aQ9DB34 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Chmp2aQ9DB34 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Chmp2aQ9DB34 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Chmp2aQ9DB34 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Chmp2aQ9DB34 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Chmp2aQ9DB34 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Chmp2aQ9DB34 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Chmp2aQ9DB34 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Chmp2aQ9DB34 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Chmp2aQ9DB34 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
Chmp2aQ9DB34 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
Chmp2aQ9DB34 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Chmp2aQ9DB34 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Chmp2aQ9DB34 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Chmp2aQ9DB34 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Chmp2aQ9DB34 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Chmp2aQ9DB34 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Chmp2aQ9DB34 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Chmp2aQ9DB34 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Chmp2aQ9DB34 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Chmp2aQ9DB34 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
Chmp2aQ9DB34 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Chmp2aQ9DB34 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Chmp2aQ9DB34 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Chmp2aQ9DB34 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Chmp2aQ9DB34 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Chmp2aQ9DB34 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Chmp2aQ9DB34 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Chmp2aQ9DB34 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Chmp2aQ9DB34 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Chmp2aQ9DB34 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Chmp2aQ9DB34 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Chmp2aQ9DB34 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
Chmp2aQ9DB34 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
Chmp2aQ9DB34 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Chmp2aQ9DB34 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Chmp2aQ9DB34 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Chmp2aQ9DB34 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Chmp2aQ9DB34 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Chmp2aQ9DB34 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Chmp2aQ9DB34 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Chmp2aQ9DB34 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Chmp2aQ9DB34 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Chmp2aQ9DB34 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Chmp2aQ9DB34 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Chmp2aQ9DB34 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Chmp2aQ9DB34 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Chmp2aQ9DB34 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Chmp2aQ9DB34 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
Chmp2aQ9DB34 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Chmp2aQ9DB34 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Chmp2aQ9DB34 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
Chmp2aQ9DB34 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Chmp2aQ9DB34 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Chmp2aQ9DB34 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Chmp2aQ9DB34 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Chmp2aQ9DB34 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
Chmp2aQ9DB34 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Chmp2aQ9DB34 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Chmp2aQ9DB34 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Chmp2aQ9DB34 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Chmp2aQ9DB34 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Chmp2aQ9DB34 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Chmp2aQ9DB34 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Chmp2aQ9DB34 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Chmp2aQ9DB34 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Chmp2aQ9DB34 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Chmp2aQ9DB34 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Chmp2aQ9DB34 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Chmp2aQ9DB34 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Chmp2aQ9DB34 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Chmp2aQ9DB34 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Chmp2aQ9DB34 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Chmp2aQ9DB34 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Chmp2aQ9DB34 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Chmp2aQ9DB34 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Chmp2aQ9DB34 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Chmp2aQ9DB34 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Chmp2aQ9DB34 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
Chmp2aQ9DB34 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Chmp2aQ9DB34 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Chmp2aQ9DB34 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Chmp2aQ9DB34 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Chmp2aQ9DB34 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Chmp2aQ9DB34 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Chmp2aQ9DB34 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Chmp2aQ9DB34 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Chmp2aQ9DB34 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Chmp2aQ9DB34 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Chmp2aQ9DB34 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Chmp2aQ9DB34 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.7 ms