Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB20

Atp5o, ATP synthase subunit O, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp5oQ9DB20 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Atp5oQ9DB20 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Atp5oQ9DB20 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Atp5oQ9DB20 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Atp5oQ9DB20 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Atp5oQ9DB20 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Atp5oQ9DB20 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Atp5oQ9DB20 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Atp5oQ9DB20 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Atp5oQ9DB20 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Atp5oQ9DB20 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Atp5oQ9DB20 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Atp5oQ9DB20 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Atp5oQ9DB20 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Atp5oQ9DB20 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Atp5oQ9DB20 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Atp5oQ9DB20 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Atp5oQ9DB20 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Atp5oQ9DB20 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Atp5oQ9DB20 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Atp5oQ9DB20 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Atp5oQ9DB20 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Atp5oQ9DB20 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Atp5oQ9DB20 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Atp5oQ9DB20 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Atp5oQ9DB20 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Atp5oQ9DB20 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Atp5oQ9DB20 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Atp5oQ9DB20 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Atp5oQ9DB20 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Atp5oQ9DB20 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Atp5oQ9DB20 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Atp5oQ9DB20 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Atp5oQ9DB20 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Atp5oQ9DB20 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Atp5oQ9DB20 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Atp5oQ9DB20 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Atp5oQ9DB20 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Atp5oQ9DB20 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Atp5oQ9DB20 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Atp5oQ9DB20 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Atp5oQ9DB20 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Atp5oQ9DB20 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Atp5oQ9DB20 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Atp5oQ9DB20 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Atp5oQ9DB20 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Atp5oQ9DB20 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Atp5oQ9DB20 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Atp5oQ9DB20 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Atp5oQ9DB20 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Atp5oQ9DB20 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Atp5oQ9DB20 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Atp5oQ9DB20 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Atp5oQ9DB20 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Atp5oQ9DB20 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Atp5oQ9DB20 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Atp5oQ9DB20 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Atp5oQ9DB20 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Atp5oQ9DB20 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Atp5oQ9DB20 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Atp5oQ9DB20 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Atp5oQ9DB20 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Atp5oQ9DB20 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Atp5oQ9DB20 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Atp5oQ9DB20 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Atp5oQ9DB20 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Atp5oQ9DB20 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Atp5oQ9DB20 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Atp5oQ9DB20 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Atp5oQ9DB20 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Atp5oQ9DB20 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
Atp5oQ9DB20 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Atp5oQ9DB20 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Atp5oQ9DB20 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Atp5oQ9DB20 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Atp5oQ9DB20 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Atp5oQ9DB20 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Atp5oQ9DB20 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Atp5oQ9DB20 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Atp5oQ9DB20 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Atp5oQ9DB20 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Atp5oQ9DB20 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Atp5oQ9DB20 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Atp5oQ9DB20 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
Atp5oQ9DB20 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Atp5oQ9DB20 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Atp5oQ9DB20 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Atp5oQ9DB20 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Atp5oQ9DB20 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Atp5oQ9DB20 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Atp5oQ9DB20 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Atp5oQ9DB20 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
Atp5oQ9DB20 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Atp5oQ9DB20 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Atp5oQ9DB20 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Atp5oQ9DB20 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Atp5oQ9DB20 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Atp5oQ9DB20 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Atp5oQ9DB20 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Atp5oQ9DB20 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms