Protein–RNA interactions for Protein: Q9DAP7

Asf1b, Histone chaperone ASF1B, mousemouse

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Asf1bQ9DAP7 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
Asf1bQ9DAP7 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Asf1bQ9DAP7 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Asf1bQ9DAP7 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Asf1bQ9DAP7 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Asf1bQ9DAP7 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Asf1bQ9DAP7 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Asf1bQ9DAP7 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Asf1bQ9DAP7 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Asf1bQ9DAP7 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Asf1bQ9DAP7 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Asf1bQ9DAP7 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Asf1bQ9DAP7 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Asf1bQ9DAP7 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Asf1bQ9DAP7 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Asf1bQ9DAP7 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Asf1bQ9DAP7 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Asf1bQ9DAP7 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Asf1bQ9DAP7 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Asf1bQ9DAP7 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Asf1bQ9DAP7 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Asf1bQ9DAP7 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Asf1bQ9DAP7 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Asf1bQ9DAP7 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Asf1bQ9DAP7 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Asf1bQ9DAP7 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Asf1bQ9DAP7 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Asf1bQ9DAP7 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Asf1bQ9DAP7 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Asf1bQ9DAP7 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Asf1bQ9DAP7 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Asf1bQ9DAP7 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Asf1bQ9DAP7 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Asf1bQ9DAP7 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Asf1bQ9DAP7 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Asf1bQ9DAP7 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Asf1bQ9DAP7 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Asf1bQ9DAP7 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Asf1bQ9DAP7 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Asf1bQ9DAP7 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Asf1bQ9DAP7 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Asf1bQ9DAP7 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Asf1bQ9DAP7 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
Asf1bQ9DAP7 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Asf1bQ9DAP7 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Asf1bQ9DAP7 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Asf1bQ9DAP7 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Asf1bQ9DAP7 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Asf1bQ9DAP7 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Asf1bQ9DAP7 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Asf1bQ9DAP7 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
Asf1bQ9DAP7 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Asf1bQ9DAP7 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Asf1bQ9DAP7 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Asf1bQ9DAP7 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Asf1bQ9DAP7 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Asf1bQ9DAP7 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Asf1bQ9DAP7 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Asf1bQ9DAP7 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Asf1bQ9DAP7 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Asf1bQ9DAP7 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Asf1bQ9DAP7 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Asf1bQ9DAP7 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Asf1bQ9DAP7 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Asf1bQ9DAP7 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Asf1bQ9DAP7 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Asf1bQ9DAP7 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Asf1bQ9DAP7 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Asf1bQ9DAP7 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Asf1bQ9DAP7 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Asf1bQ9DAP7 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Asf1bQ9DAP7 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Asf1bQ9DAP7 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Asf1bQ9DAP7 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Asf1bQ9DAP7 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Asf1bQ9DAP7 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Asf1bQ9DAP7 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Asf1bQ9DAP7 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Asf1bQ9DAP7 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Asf1bQ9DAP7 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Asf1bQ9DAP7 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Asf1bQ9DAP7 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Asf1bQ9DAP7 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Asf1bQ9DAP7 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Asf1bQ9DAP7 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Asf1bQ9DAP7 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Asf1bQ9DAP7 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Asf1bQ9DAP7 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Asf1bQ9DAP7 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Asf1bQ9DAP7 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Asf1bQ9DAP7 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Asf1bQ9DAP7 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Asf1bQ9DAP7 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Asf1bQ9DAP7 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Asf1bQ9DAP7 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Asf1bQ9DAP7 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Asf1bQ9DAP7 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Asf1bQ9DAP7 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Asf1bQ9DAP7 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Asf1bQ9DAP7 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.7 ms