Protein–RNA interactions for Protein: Q9DAF1

1700012A03Rik, RIKEN cDNA 1700012A03 gene, mousemouse

Predictions only

Length 130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700012A03RikQ9DAF1 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
1700012A03RikQ9DAF1 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
1700012A03RikQ9DAF1 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
1700012A03RikQ9DAF1 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
1700012A03RikQ9DAF1 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
1700012A03RikQ9DAF1 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
1700012A03RikQ9DAF1 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
1700012A03RikQ9DAF1 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
1700012A03RikQ9DAF1 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
1700012A03RikQ9DAF1 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
1700012A03RikQ9DAF1 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
1700012A03RikQ9DAF1 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
1700012A03RikQ9DAF1 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
1700012A03RikQ9DAF1 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
1700012A03RikQ9DAF1 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
1700012A03RikQ9DAF1 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
1700012A03RikQ9DAF1 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
1700012A03RikQ9DAF1 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
1700012A03RikQ9DAF1 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
1700012A03RikQ9DAF1 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
1700012A03RikQ9DAF1 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
1700012A03RikQ9DAF1 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
1700012A03RikQ9DAF1 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
1700012A03RikQ9DAF1 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
1700012A03RikQ9DAF1 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
1700012A03RikQ9DAF1 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
1700012A03RikQ9DAF1 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
1700012A03RikQ9DAF1 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
1700012A03RikQ9DAF1 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
1700012A03RikQ9DAF1 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
1700012A03RikQ9DAF1 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
1700012A03RikQ9DAF1 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
1700012A03RikQ9DAF1 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
1700012A03RikQ9DAF1 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
1700012A03RikQ9DAF1 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
1700012A03RikQ9DAF1 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
1700012A03RikQ9DAF1 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
1700012A03RikQ9DAF1 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
1700012A03RikQ9DAF1 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
1700012A03RikQ9DAF1 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
1700012A03RikQ9DAF1 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
1700012A03RikQ9DAF1 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
1700012A03RikQ9DAF1 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
1700012A03RikQ9DAF1 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
1700012A03RikQ9DAF1 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
1700012A03RikQ9DAF1 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
1700012A03RikQ9DAF1 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
1700012A03RikQ9DAF1 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
1700012A03RikQ9DAF1 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
1700012A03RikQ9DAF1 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
1700012A03RikQ9DAF1 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
1700012A03RikQ9DAF1 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
1700012A03RikQ9DAF1 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
1700012A03RikQ9DAF1 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
1700012A03RikQ9DAF1 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
1700012A03RikQ9DAF1 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
1700012A03RikQ9DAF1 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
1700012A03RikQ9DAF1 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
1700012A03RikQ9DAF1 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
1700012A03RikQ9DAF1 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
1700012A03RikQ9DAF1 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
1700012A03RikQ9DAF1 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
1700012A03RikQ9DAF1 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
1700012A03RikQ9DAF1 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
1700012A03RikQ9DAF1 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
1700012A03RikQ9DAF1 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
1700012A03RikQ9DAF1 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
1700012A03RikQ9DAF1 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
1700012A03RikQ9DAF1 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
1700012A03RikQ9DAF1 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
1700012A03RikQ9DAF1 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
1700012A03RikQ9DAF1 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
1700012A03RikQ9DAF1 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
1700012A03RikQ9DAF1 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
1700012A03RikQ9DAF1 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
1700012A03RikQ9DAF1 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
1700012A03RikQ9DAF1 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
1700012A03RikQ9DAF1 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
1700012A03RikQ9DAF1 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
1700012A03RikQ9DAF1 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
1700012A03RikQ9DAF1 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
1700012A03RikQ9DAF1 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
1700012A03RikQ9DAF1 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
1700012A03RikQ9DAF1 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
1700012A03RikQ9DAF1 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
1700012A03RikQ9DAF1 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
1700012A03RikQ9DAF1 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
1700012A03RikQ9DAF1 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
1700012A03RikQ9DAF1 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
1700012A03RikQ9DAF1 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
1700012A03RikQ9DAF1 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
1700012A03RikQ9DAF1 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
1700012A03RikQ9DAF1 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
1700012A03RikQ9DAF1 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
1700012A03RikQ9DAF1 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
1700012A03RikQ9DAF1 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
1700012A03RikQ9DAF1 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
1700012A03RikQ9DAF1 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
1700012A03RikQ9DAF1 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
1700012A03RikQ9DAF1 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.3 ms