Protein–RNA interactions for Protein: Q9DAB5

H2bfm, H2B histone family, member M, mousemouse

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2bfmQ9DAB5 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
H2bfmQ9DAB5 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
H2bfmQ9DAB5 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
H2bfmQ9DAB5 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
H2bfmQ9DAB5 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
H2bfmQ9DAB5 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
H2bfmQ9DAB5 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
H2bfmQ9DAB5 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
H2bfmQ9DAB5 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
H2bfmQ9DAB5 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
H2bfmQ9DAB5 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
H2bfmQ9DAB5 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
H2bfmQ9DAB5 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
H2bfmQ9DAB5 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.22
H2bfmQ9DAB5 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
H2bfmQ9DAB5 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
H2bfmQ9DAB5 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
H2bfmQ9DAB5 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
H2bfmQ9DAB5 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
H2bfmQ9DAB5 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
H2bfmQ9DAB5 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
H2bfmQ9DAB5 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
H2bfmQ9DAB5 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
H2bfmQ9DAB5 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
H2bfmQ9DAB5 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
H2bfmQ9DAB5 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
H2bfmQ9DAB5 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
H2bfmQ9DAB5 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
H2bfmQ9DAB5 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
H2bfmQ9DAB5 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
H2bfmQ9DAB5 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
H2bfmQ9DAB5 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
H2bfmQ9DAB5 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
H2bfmQ9DAB5 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
H2bfmQ9DAB5 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
H2bfmQ9DAB5 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
H2bfmQ9DAB5 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
H2bfmQ9DAB5 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
H2bfmQ9DAB5 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
H2bfmQ9DAB5 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
H2bfmQ9DAB5 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
H2bfmQ9DAB5 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
H2bfmQ9DAB5 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
H2bfmQ9DAB5 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
H2bfmQ9DAB5 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
H2bfmQ9DAB5 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
H2bfmQ9DAB5 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
H2bfmQ9DAB5 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
H2bfmQ9DAB5 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
H2bfmQ9DAB5 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
H2bfmQ9DAB5 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
H2bfmQ9DAB5 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
H2bfmQ9DAB5 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
H2bfmQ9DAB5 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
H2bfmQ9DAB5 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
H2bfmQ9DAB5 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
H2bfmQ9DAB5 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
H2bfmQ9DAB5 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
H2bfmQ9DAB5 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
H2bfmQ9DAB5 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
H2bfmQ9DAB5 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
H2bfmQ9DAB5 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
H2bfmQ9DAB5 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
H2bfmQ9DAB5 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
H2bfmQ9DAB5 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
H2bfmQ9DAB5 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
H2bfmQ9DAB5 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
H2bfmQ9DAB5 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
H2bfmQ9DAB5 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
H2bfmQ9DAB5 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
H2bfmQ9DAB5 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
H2bfmQ9DAB5 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
H2bfmQ9DAB5 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
H2bfmQ9DAB5 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
H2bfmQ9DAB5 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
H2bfmQ9DAB5 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
H2bfmQ9DAB5 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
H2bfmQ9DAB5 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
H2bfmQ9DAB5 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
H2bfmQ9DAB5 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
H2bfmQ9DAB5 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
H2bfmQ9DAB5 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
H2bfmQ9DAB5 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
H2bfmQ9DAB5 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
H2bfmQ9DAB5 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
H2bfmQ9DAB5 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
H2bfmQ9DAB5 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
H2bfmQ9DAB5 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
H2bfmQ9DAB5 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
H2bfmQ9DAB5 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
H2bfmQ9DAB5 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
H2bfmQ9DAB5 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
H2bfmQ9DAB5 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
H2bfmQ9DAB5 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
H2bfmQ9DAB5 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
H2bfmQ9DAB5 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
H2bfmQ9DAB5 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
H2bfmQ9DAB5 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
H2bfmQ9DAB5 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
H2bfmQ9DAB5 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.3 ms