Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA37

Samd8, Sphingomyelin synthase-related protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samd8Q9DA37 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Samd8Q9DA37 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Samd8Q9DA37 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Samd8Q9DA37 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Samd8Q9DA37 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Samd8Q9DA37 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Samd8Q9DA37 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Samd8Q9DA37 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Samd8Q9DA37 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Samd8Q9DA37 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Samd8Q9DA37 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Samd8Q9DA37 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Samd8Q9DA37 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Samd8Q9DA37 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Samd8Q9DA37 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Samd8Q9DA37 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Samd8Q9DA37 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Samd8Q9DA37 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Samd8Q9DA37 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Samd8Q9DA37 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Samd8Q9DA37 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Samd8Q9DA37 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Samd8Q9DA37 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Samd8Q9DA37 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Samd8Q9DA37 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Samd8Q9DA37 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Samd8Q9DA37 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Samd8Q9DA37 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Samd8Q9DA37 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Samd8Q9DA37 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Samd8Q9DA37 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Samd8Q9DA37 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Samd8Q9DA37 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Samd8Q9DA37 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Samd8Q9DA37 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Samd8Q9DA37 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Samd8Q9DA37 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Samd8Q9DA37 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Samd8Q9DA37 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Samd8Q9DA37 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Samd8Q9DA37 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Samd8Q9DA37 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Samd8Q9DA37 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Samd8Q9DA37 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Samd8Q9DA37 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Samd8Q9DA37 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Samd8Q9DA37 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Samd8Q9DA37 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Samd8Q9DA37 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Samd8Q9DA37 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Samd8Q9DA37 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Samd8Q9DA37 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Samd8Q9DA37 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Samd8Q9DA37 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Samd8Q9DA37 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Samd8Q9DA37 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Samd8Q9DA37 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Samd8Q9DA37 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Samd8Q9DA37 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Samd8Q9DA37 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Samd8Q9DA37 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Samd8Q9DA37 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Samd8Q9DA37 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Samd8Q9DA37 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Samd8Q9DA37 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Samd8Q9DA37 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Samd8Q9DA37 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Samd8Q9DA37 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Samd8Q9DA37 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Samd8Q9DA37 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Samd8Q9DA37 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Samd8Q9DA37 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Samd8Q9DA37 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Samd8Q9DA37 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Samd8Q9DA37 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Samd8Q9DA37 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Samd8Q9DA37 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Samd8Q9DA37 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Samd8Q9DA37 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Samd8Q9DA37 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Samd8Q9DA37 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Samd8Q9DA37 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Samd8Q9DA37 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Samd8Q9DA37 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Samd8Q9DA37 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Samd8Q9DA37 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Samd8Q9DA37 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Samd8Q9DA37 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Samd8Q9DA37 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Samd8Q9DA37 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Samd8Q9DA37 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Samd8Q9DA37 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Samd8Q9DA37 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Samd8Q9DA37 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Samd8Q9DA37 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Samd8Q9DA37 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Samd8Q9DA37 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Samd8Q9DA37 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Samd8Q9DA37 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Samd8Q9DA37 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 308.2 ms