Protein–RNA interactions for Protein: Q9D968

Hcfc2, Host cell factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hcfc2Q9D968 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Hcfc2Q9D968 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Hcfc2Q9D968 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Hcfc2Q9D968 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Hcfc2Q9D968 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Hcfc2Q9D968 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Hcfc2Q9D968 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Hcfc2Q9D968 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Hcfc2Q9D968 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Hcfc2Q9D968 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Hcfc2Q9D968 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Hcfc2Q9D968 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Hcfc2Q9D968 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Hcfc2Q9D968 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Hcfc2Q9D968 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Hcfc2Q9D968 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Hcfc2Q9D968 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Hcfc2Q9D968 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Hcfc2Q9D968 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Hcfc2Q9D968 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Hcfc2Q9D968 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Hcfc2Q9D968 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Hcfc2Q9D968 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Hcfc2Q9D968 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hcfc2Q9D968 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hcfc2Q9D968 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Hcfc2Q9D968 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hcfc2Q9D968 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Hcfc2Q9D968 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Hcfc2Q9D968 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Hcfc2Q9D968 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Hcfc2Q9D968 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Hcfc2Q9D968 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Hcfc2Q9D968 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Hcfc2Q9D968 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Hcfc2Q9D968 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Hcfc2Q9D968 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Hcfc2Q9D968 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Hcfc2Q9D968 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Hcfc2Q9D968 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Hcfc2Q9D968 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Hcfc2Q9D968 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Hcfc2Q9D968 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Hcfc2Q9D968 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Hcfc2Q9D968 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Hcfc2Q9D968 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Hcfc2Q9D968 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Hcfc2Q9D968 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Hcfc2Q9D968 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Hcfc2Q9D968 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Hcfc2Q9D968 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Hcfc2Q9D968 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Hcfc2Q9D968 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hcfc2Q9D968 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hcfc2Q9D968 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Hcfc2Q9D968 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Hcfc2Q9D968 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hcfc2Q9D968 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hcfc2Q9D968 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Hcfc2Q9D968 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hcfc2Q9D968 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hcfc2Q9D968 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hcfc2Q9D968 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hcfc2Q9D968 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hcfc2Q9D968 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Hcfc2Q9D968 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Hcfc2Q9D968 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Hcfc2Q9D968 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Hcfc2Q9D968 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Hcfc2Q9D968 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Hcfc2Q9D968 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Hcfc2Q9D968 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Hcfc2Q9D968 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Hcfc2Q9D968 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Hcfc2Q9D968 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Hcfc2Q9D968 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Hcfc2Q9D968 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Hcfc2Q9D968 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Hcfc2Q9D968 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Hcfc2Q9D968 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Hcfc2Q9D968 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Hcfc2Q9D968 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Hcfc2Q9D968 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Hcfc2Q9D968 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Hcfc2Q9D968 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Hcfc2Q9D968 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Hcfc2Q9D968 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Hcfc2Q9D968 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Hcfc2Q9D968 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Hcfc2Q9D968 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Hcfc2Q9D968 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Hcfc2Q9D968 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Hcfc2Q9D968 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Hcfc2Q9D968 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Hcfc2Q9D968 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Hcfc2Q9D968 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Hcfc2Q9D968 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Hcfc2Q9D968 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Hcfc2Q9D968 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Hcfc2Q9D968 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms