Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8T4

Tvp23b, Golgi apparatus membrane protein TVP23 homolog B, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tvp23bQ9D8T4 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tvp23bQ9D8T4 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tvp23bQ9D8T4 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tvp23bQ9D8T4 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Tvp23bQ9D8T4 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Tvp23bQ9D8T4 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Tvp23bQ9D8T4 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Tvp23bQ9D8T4 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Tvp23bQ9D8T4 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Tvp23bQ9D8T4 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Tvp23bQ9D8T4 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Tvp23bQ9D8T4 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Tvp23bQ9D8T4 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Tvp23bQ9D8T4 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Tvp23bQ9D8T4 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Tvp23bQ9D8T4 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Tvp23bQ9D8T4 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Tvp23bQ9D8T4 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Tvp23bQ9D8T4 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Tvp23bQ9D8T4 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Tvp23bQ9D8T4 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Tvp23bQ9D8T4 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Tvp23bQ9D8T4 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Tvp23bQ9D8T4 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Tvp23bQ9D8T4 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Tvp23bQ9D8T4 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Tvp23bQ9D8T4 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Tvp23bQ9D8T4 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Tvp23bQ9D8T4 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Tvp23bQ9D8T4 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Tvp23bQ9D8T4 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Tvp23bQ9D8T4 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Tvp23bQ9D8T4 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Tvp23bQ9D8T4 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Tvp23bQ9D8T4 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Tvp23bQ9D8T4 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Tvp23bQ9D8T4 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Tvp23bQ9D8T4 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Tvp23bQ9D8T4 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Tvp23bQ9D8T4 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Tvp23bQ9D8T4 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Tvp23bQ9D8T4 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Tvp23bQ9D8T4 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Tvp23bQ9D8T4 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Tvp23bQ9D8T4 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Tvp23bQ9D8T4 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Tvp23bQ9D8T4 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Tvp23bQ9D8T4 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Tvp23bQ9D8T4 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Tvp23bQ9D8T4 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Tvp23bQ9D8T4 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Tvp23bQ9D8T4 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Tvp23bQ9D8T4 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Tvp23bQ9D8T4 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Tvp23bQ9D8T4 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Tvp23bQ9D8T4 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Tvp23bQ9D8T4 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Tvp23bQ9D8T4 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Tvp23bQ9D8T4 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Tvp23bQ9D8T4 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Tvp23bQ9D8T4 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Tvp23bQ9D8T4 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Tvp23bQ9D8T4 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tvp23bQ9D8T4 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tvp23bQ9D8T4 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tvp23bQ9D8T4 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tvp23bQ9D8T4 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tvp23bQ9D8T4 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Tvp23bQ9D8T4 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tvp23bQ9D8T4 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tvp23bQ9D8T4 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tvp23bQ9D8T4 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tvp23bQ9D8T4 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tvp23bQ9D8T4 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tvp23bQ9D8T4 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tvp23bQ9D8T4 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tvp23bQ9D8T4 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tvp23bQ9D8T4 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Tvp23bQ9D8T4 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Tvp23bQ9D8T4 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tvp23bQ9D8T4 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tvp23bQ9D8T4 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tvp23bQ9D8T4 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tvp23bQ9D8T4 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tvp23bQ9D8T4 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tvp23bQ9D8T4 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tvp23bQ9D8T4 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tvp23bQ9D8T4 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tvp23bQ9D8T4 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tvp23bQ9D8T4 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tvp23bQ9D8T4 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tvp23bQ9D8T4 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tvp23bQ9D8T4 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Tvp23bQ9D8T4 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tvp23bQ9D8T4 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tvp23bQ9D8T4 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Tvp23bQ9D8T4 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tvp23bQ9D8T4 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tvp23bQ9D8T4 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tvp23bQ9D8T4 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.5 ms