Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8P7

Gtf3c6, General transcription factor 3C polypeptide 6, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf3c6Q9D8P7 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Gtf3c6Q9D8P7 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Gtf3c6Q9D8P7 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
Gtf3c6Q9D8P7 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Gtf3c6Q9D8P7 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Gtf3c6Q9D8P7 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Gtf3c6Q9D8P7 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Gtf3c6Q9D8P7 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Gtf3c6Q9D8P7 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Gtf3c6Q9D8P7 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Gtf3c6Q9D8P7 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Gtf3c6Q9D8P7 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Gtf3c6Q9D8P7 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Gtf3c6Q9D8P7 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Gtf3c6Q9D8P7 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Gtf3c6Q9D8P7 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Gtf3c6Q9D8P7 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Gtf3c6Q9D8P7 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Gtf3c6Q9D8P7 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Gtf3c6Q9D8P7 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Gtf3c6Q9D8P7 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Gtf3c6Q9D8P7 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Gtf3c6Q9D8P7 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Gtf3c6Q9D8P7 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Gtf3c6Q9D8P7 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Gtf3c6Q9D8P7 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Gtf3c6Q9D8P7 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Gtf3c6Q9D8P7 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Gtf3c6Q9D8P7 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Gtf3c6Q9D8P7 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Gtf3c6Q9D8P7 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Gtf3c6Q9D8P7 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Gtf3c6Q9D8P7 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Gtf3c6Q9D8P7 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Gtf3c6Q9D8P7 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Gtf3c6Q9D8P7 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
Gtf3c6Q9D8P7 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Gtf3c6Q9D8P7 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Gtf3c6Q9D8P7 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Gtf3c6Q9D8P7 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Gtf3c6Q9D8P7 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Gtf3c6Q9D8P7 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Gtf3c6Q9D8P7 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Gtf3c6Q9D8P7 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
Gtf3c6Q9D8P7 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Gtf3c6Q9D8P7 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Gtf3c6Q9D8P7 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Gtf3c6Q9D8P7 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Gtf3c6Q9D8P7 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
Gtf3c6Q9D8P7 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Gtf3c6Q9D8P7 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Gtf3c6Q9D8P7 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Gtf3c6Q9D8P7 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Gtf3c6Q9D8P7 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Gtf3c6Q9D8P7 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Gtf3c6Q9D8P7 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Gtf3c6Q9D8P7 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Gtf3c6Q9D8P7 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
Gtf3c6Q9D8P7 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Gtf3c6Q9D8P7 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Gtf3c6Q9D8P7 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Gtf3c6Q9D8P7 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Gtf3c6Q9D8P7 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Gtf3c6Q9D8P7 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Gtf3c6Q9D8P7 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Gtf3c6Q9D8P7 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Gtf3c6Q9D8P7 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Gtf3c6Q9D8P7 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Gtf3c6Q9D8P7 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Gtf3c6Q9D8P7 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Gtf3c6Q9D8P7 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Gtf3c6Q9D8P7 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Gtf3c6Q9D8P7 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Gtf3c6Q9D8P7 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
Gtf3c6Q9D8P7 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Gtf3c6Q9D8P7 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Gtf3c6Q9D8P7 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
Gtf3c6Q9D8P7 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Gtf3c6Q9D8P7 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Gtf3c6Q9D8P7 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Gtf3c6Q9D8P7 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Gtf3c6Q9D8P7 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Gtf3c6Q9D8P7 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Gtf3c6Q9D8P7 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Gtf3c6Q9D8P7 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Gtf3c6Q9D8P7 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Gtf3c6Q9D8P7 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
Gtf3c6Q9D8P7 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Gtf3c6Q9D8P7 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Gtf3c6Q9D8P7 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Gtf3c6Q9D8P7 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Gtf3c6Q9D8P7 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Gtf3c6Q9D8P7 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Gtf3c6Q9D8P7 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Gtf3c6Q9D8P7 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Gtf3c6Q9D8P7 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Gtf3c6Q9D8P7 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Gtf3c6Q9D8P7 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Gtf3c6Q9D8P7 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Gtf3c6Q9D8P7 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.4 ms