Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8N1

Uncharacterized protein C11orf24 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 392 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D8N1 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Q9D8N1 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Q9D8N1 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Q9D8N1 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Q9D8N1 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Q9D8N1 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Q9D8N1 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Q9D8N1 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Q9D8N1 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Q9D8N1 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Q9D8N1 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Q9D8N1 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Q9D8N1 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Q9D8N1 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Q9D8N1 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Q9D8N1 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Q9D8N1 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Q9D8N1 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Q9D8N1 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Q9D8N1 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Q9D8N1 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Q9D8N1 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Q9D8N1 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Q9D8N1 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Q9D8N1 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Q9D8N1 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Q9D8N1 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Q9D8N1 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Q9D8N1 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Q9D8N1 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Q9D8N1 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Q9D8N1 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Q9D8N1 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Q9D8N1 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Q9D8N1 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Q9D8N1 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Q9D8N1 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Q9D8N1 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Q9D8N1 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Q9D8N1 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Q9D8N1 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Q9D8N1 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Q9D8N1 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Q9D8N1 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Q9D8N1 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Q9D8N1 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Q9D8N1 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Q9D8N1 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Q9D8N1 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Q9D8N1 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Q9D8N1 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Q9D8N1 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Q9D8N1 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Q9D8N1 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Q9D8N1 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Q9D8N1 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Q9D8N1 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Q9D8N1 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Q9D8N1 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Q9D8N1 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Q9D8N1 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Q9D8N1 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Q9D8N1 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Q9D8N1 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Q9D8N1 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Q9D8N1 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Q9D8N1 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Q9D8N1 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Q9D8N1 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Q9D8N1 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Q9D8N1 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Q9D8N1 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Q9D8N1 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Q9D8N1 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC21.33■■□□□ 1
Q9D8N1 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Q9D8N1 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Q9D8N1 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Q9D8N1 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Q9D8N1 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Q9D8N1 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Q9D8N1 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Q9D8N1 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Q9D8N1 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Q9D8N1 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Q9D8N1 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Q9D8N1 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Q9D8N1 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Q9D8N1 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Q9D8N1 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Q9D8N1 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Q9D8N1 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Q9D8N1 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Q9D8N1 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Q9D8N1 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Q9D8N1 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Q9D8N1 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Q9D8N1 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Q9D8N1 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Q9D8N1 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Q9D8N1 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 272.1 ms