Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8L5

Ccdc91, Coiled-coil domain-containing protein 91, mousemouse

Predictions only

Length 442 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc91Q9D8L5 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Ccdc91Q9D8L5 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Ccdc91Q9D8L5 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Ccdc91Q9D8L5 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Ccdc91Q9D8L5 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Ccdc91Q9D8L5 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Ccdc91Q9D8L5 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Ccdc91Q9D8L5 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC26.2■■□□□ 1.79
Ccdc91Q9D8L5 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Ccdc91Q9D8L5 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Ccdc91Q9D8L5 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Ccdc91Q9D8L5 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Ccdc91Q9D8L5 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Ccdc91Q9D8L5 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Ccdc91Q9D8L5 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
Ccdc91Q9D8L5 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Ccdc91Q9D8L5 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Ccdc91Q9D8L5 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Ccdc91Q9D8L5 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Ccdc91Q9D8L5 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Ccdc91Q9D8L5 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
Ccdc91Q9D8L5 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
Ccdc91Q9D8L5 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Ccdc91Q9D8L5 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Ccdc91Q9D8L5 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Ccdc91Q9D8L5 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Ccdc91Q9D8L5 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Ccdc91Q9D8L5 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Ccdc91Q9D8L5 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Ccdc91Q9D8L5 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Ccdc91Q9D8L5 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Ccdc91Q9D8L5 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Ccdc91Q9D8L5 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Ccdc91Q9D8L5 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Ccdc91Q9D8L5 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Ccdc91Q9D8L5 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Ccdc91Q9D8L5 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
Ccdc91Q9D8L5 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Ccdc91Q9D8L5 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
Ccdc91Q9D8L5 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Ccdc91Q9D8L5 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Ccdc91Q9D8L5 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Ccdc91Q9D8L5 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Ccdc91Q9D8L5 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Ccdc91Q9D8L5 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Ccdc91Q9D8L5 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Ccdc91Q9D8L5 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Ccdc91Q9D8L5 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Ccdc91Q9D8L5 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Ccdc91Q9D8L5 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Ccdc91Q9D8L5 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Ccdc91Q9D8L5 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Ccdc91Q9D8L5 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Ccdc91Q9D8L5 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Ccdc91Q9D8L5 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Ccdc91Q9D8L5 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
Ccdc91Q9D8L5 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
Ccdc91Q9D8L5 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Ccdc91Q9D8L5 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Ccdc91Q9D8L5 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Ccdc91Q9D8L5 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Ccdc91Q9D8L5 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Ccdc91Q9D8L5 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Ccdc91Q9D8L5 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Ccdc91Q9D8L5 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.75
Ccdc91Q9D8L5 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Ccdc91Q9D8L5 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Ccdc91Q9D8L5 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Ccdc91Q9D8L5 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Ccdc91Q9D8L5 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Ccdc91Q9D8L5 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Ccdc91Q9D8L5 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Ccdc91Q9D8L5 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Ccdc91Q9D8L5 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Ccdc91Q9D8L5 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.73
Ccdc91Q9D8L5 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Ccdc91Q9D8L5 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Ccdc91Q9D8L5 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Ccdc91Q9D8L5 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Ccdc91Q9D8L5 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Ccdc91Q9D8L5 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Ccdc91Q9D8L5 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Ccdc91Q9D8L5 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Ccdc91Q9D8L5 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Ccdc91Q9D8L5 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Ccdc91Q9D8L5 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Ccdc91Q9D8L5 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Ccdc91Q9D8L5 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Ccdc91Q9D8L5 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Ccdc91Q9D8L5 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Ccdc91Q9D8L5 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Ccdc91Q9D8L5 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Ccdc91Q9D8L5 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Ccdc91Q9D8L5 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Ccdc91Q9D8L5 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Ccdc91Q9D8L5 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Ccdc91Q9D8L5 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Ccdc91Q9D8L5 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Ccdc91Q9D8L5 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Ccdc91Q9D8L5 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74 ms