Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8D0

Tnfrsf13c, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 13C, mousemouse

Predictions only

Length 175 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Tnfrsf13cQ9D8D0 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Tnfrsf13cQ9D8D0 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Tnfrsf13cQ9D8D0 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Tnfrsf13cQ9D8D0 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Tnfrsf13cQ9D8D0 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Tnfrsf13cQ9D8D0 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Tnfrsf13cQ9D8D0 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Tnfrsf13cQ9D8D0 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Tnfrsf13cQ9D8D0 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Tnfrsf13cQ9D8D0 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Tnfrsf13cQ9D8D0 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Tnfrsf13cQ9D8D0 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Tnfrsf13cQ9D8D0 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Tnfrsf13cQ9D8D0 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Tnfrsf13cQ9D8D0 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Tnfrsf13cQ9D8D0 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Tnfrsf13cQ9D8D0 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Tnfrsf13cQ9D8D0 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Tnfrsf13cQ9D8D0 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Tnfrsf13cQ9D8D0 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Tnfrsf13cQ9D8D0 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Tnfrsf13cQ9D8D0 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Tnfrsf13cQ9D8D0 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Tnfrsf13cQ9D8D0 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Tnfrsf13cQ9D8D0 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Tnfrsf13cQ9D8D0 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Tnfrsf13cQ9D8D0 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Tnfrsf13cQ9D8D0 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Tnfrsf13cQ9D8D0 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Tnfrsf13cQ9D8D0 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Tnfrsf13cQ9D8D0 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Tnfrsf13cQ9D8D0 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Tnfrsf13cQ9D8D0 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Tnfrsf13cQ9D8D0 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Tnfrsf13cQ9D8D0 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Tnfrsf13cQ9D8D0 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Tnfrsf13cQ9D8D0 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Tnfrsf13cQ9D8D0 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Tnfrsf13cQ9D8D0 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Tnfrsf13cQ9D8D0 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Tnfrsf13cQ9D8D0 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Tnfrsf13cQ9D8D0 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Tnfrsf13cQ9D8D0 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Tnfrsf13cQ9D8D0 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Tnfrsf13cQ9D8D0 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Tnfrsf13cQ9D8D0 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Tnfrsf13cQ9D8D0 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Tnfrsf13cQ9D8D0 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Tnfrsf13cQ9D8D0 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Tnfrsf13cQ9D8D0 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Tnfrsf13cQ9D8D0 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Tnfrsf13cQ9D8D0 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Tnfrsf13cQ9D8D0 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Tnfrsf13cQ9D8D0 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Tnfrsf13cQ9D8D0 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Tnfrsf13cQ9D8D0 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Tnfrsf13cQ9D8D0 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Tnfrsf13cQ9D8D0 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Tnfrsf13cQ9D8D0 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Tnfrsf13cQ9D8D0 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Tnfrsf13cQ9D8D0 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Tnfrsf13cQ9D8D0 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Tnfrsf13cQ9D8D0 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Tnfrsf13cQ9D8D0 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Tnfrsf13cQ9D8D0 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Tnfrsf13cQ9D8D0 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC18.83■□□□□ 0.61
Tnfrsf13cQ9D8D0 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Tnfrsf13cQ9D8D0 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Tnfrsf13cQ9D8D0 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Tnfrsf13cQ9D8D0 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Tnfrsf13cQ9D8D0 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Tnfrsf13cQ9D8D0 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Tnfrsf13cQ9D8D0 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Tnfrsf13cQ9D8D0 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Tnfrsf13cQ9D8D0 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Tnfrsf13cQ9D8D0 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Tnfrsf13cQ9D8D0 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Tnfrsf13cQ9D8D0 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Tnfrsf13cQ9D8D0 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Tnfrsf13cQ9D8D0 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Tnfrsf13cQ9D8D0 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Tnfrsf13cQ9D8D0 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tnfrsf13cQ9D8D0 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tnfrsf13cQ9D8D0 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tnfrsf13cQ9D8D0 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tnfrsf13cQ9D8D0 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tnfrsf13cQ9D8D0 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tnfrsf13cQ9D8D0 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tnfrsf13cQ9D8D0 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tnfrsf13cQ9D8D0 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Tnfrsf13cQ9D8D0 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tnfrsf13cQ9D8D0 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.4 ms