Protein–RNA interactions for Protein: Q9D855

Uqcrb, Cytochrome b-c1 complex subunit 7, mousemouse

Predictions only

Length 111 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UqcrbQ9D855 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
UqcrbQ9D855 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
UqcrbQ9D855 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
UqcrbQ9D855 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
UqcrbQ9D855 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
UqcrbQ9D855 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
UqcrbQ9D855 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
UqcrbQ9D855 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
UqcrbQ9D855 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
UqcrbQ9D855 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
UqcrbQ9D855 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
UqcrbQ9D855 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
UqcrbQ9D855 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
UqcrbQ9D855 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
UqcrbQ9D855 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
UqcrbQ9D855 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
UqcrbQ9D855 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
UqcrbQ9D855 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
UqcrbQ9D855 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
UqcrbQ9D855 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
UqcrbQ9D855 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
UqcrbQ9D855 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
UqcrbQ9D855 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
UqcrbQ9D855 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
UqcrbQ9D855 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
UqcrbQ9D855 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
UqcrbQ9D855 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
UqcrbQ9D855 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
UqcrbQ9D855 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
UqcrbQ9D855 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
UqcrbQ9D855 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
UqcrbQ9D855 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
UqcrbQ9D855 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
UqcrbQ9D855 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
UqcrbQ9D855 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
UqcrbQ9D855 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
UqcrbQ9D855 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
UqcrbQ9D855 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
UqcrbQ9D855 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
UqcrbQ9D855 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
UqcrbQ9D855 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
UqcrbQ9D855 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
UqcrbQ9D855 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
UqcrbQ9D855 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
UqcrbQ9D855 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
UqcrbQ9D855 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
UqcrbQ9D855 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
UqcrbQ9D855 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
UqcrbQ9D855 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
UqcrbQ9D855 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
UqcrbQ9D855 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
UqcrbQ9D855 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
UqcrbQ9D855 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
UqcrbQ9D855 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
UqcrbQ9D855 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
UqcrbQ9D855 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
UqcrbQ9D855 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
UqcrbQ9D855 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
UqcrbQ9D855 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
UqcrbQ9D855 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
UqcrbQ9D855 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
UqcrbQ9D855 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
UqcrbQ9D855 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
UqcrbQ9D855 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
UqcrbQ9D855 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
UqcrbQ9D855 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
UqcrbQ9D855 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
UqcrbQ9D855 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
UqcrbQ9D855 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
UqcrbQ9D855 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
UqcrbQ9D855 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
UqcrbQ9D855 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
UqcrbQ9D855 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
UqcrbQ9D855 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
UqcrbQ9D855 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
UqcrbQ9D855 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
UqcrbQ9D855 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
UqcrbQ9D855 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
UqcrbQ9D855 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
UqcrbQ9D855 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
UqcrbQ9D855 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
UqcrbQ9D855 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
UqcrbQ9D855 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
UqcrbQ9D855 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
UqcrbQ9D855 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
UqcrbQ9D855 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
UqcrbQ9D855 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
UqcrbQ9D855 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
UqcrbQ9D855 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
UqcrbQ9D855 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
UqcrbQ9D855 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
UqcrbQ9D855 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
UqcrbQ9D855 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
UqcrbQ9D855 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
UqcrbQ9D855 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
UqcrbQ9D855 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
UqcrbQ9D855 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
UqcrbQ9D855 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
UqcrbQ9D855 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
UqcrbQ9D855 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.9 ms