Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7V1

Sh2d4a, SH2 domain-containing protein 4A, mousemouse

Predictions only

Length 421 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh2d4aQ9D7V1 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Sh2d4aQ9D7V1 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Sh2d4aQ9D7V1 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Sh2d4aQ9D7V1 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Sh2d4aQ9D7V1 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Sh2d4aQ9D7V1 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Sh2d4aQ9D7V1 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Sh2d4aQ9D7V1 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Sh2d4aQ9D7V1 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Sh2d4aQ9D7V1 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Sh2d4aQ9D7V1 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Sh2d4aQ9D7V1 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Sh2d4aQ9D7V1 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Sh2d4aQ9D7V1 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Sh2d4aQ9D7V1 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Sh2d4aQ9D7V1 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Sh2d4aQ9D7V1 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Sh2d4aQ9D7V1 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Sh2d4aQ9D7V1 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Sh2d4aQ9D7V1 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Sh2d4aQ9D7V1 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Sh2d4aQ9D7V1 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Sh2d4aQ9D7V1 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Sh2d4aQ9D7V1 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Sh2d4aQ9D7V1 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Sh2d4aQ9D7V1 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Sh2d4aQ9D7V1 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Sh2d4aQ9D7V1 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Sh2d4aQ9D7V1 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Sh2d4aQ9D7V1 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Sh2d4aQ9D7V1 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Sh2d4aQ9D7V1 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Sh2d4aQ9D7V1 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Sh2d4aQ9D7V1 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Sh2d4aQ9D7V1 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Sh2d4aQ9D7V1 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Sh2d4aQ9D7V1 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Sh2d4aQ9D7V1 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Sh2d4aQ9D7V1 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Sh2d4aQ9D7V1 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Sh2d4aQ9D7V1 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Sh2d4aQ9D7V1 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Sh2d4aQ9D7V1 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Sh2d4aQ9D7V1 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Sh2d4aQ9D7V1 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Sh2d4aQ9D7V1 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Sh2d4aQ9D7V1 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Sh2d4aQ9D7V1 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Sh2d4aQ9D7V1 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Sh2d4aQ9D7V1 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Sh2d4aQ9D7V1 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Sh2d4aQ9D7V1 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Sh2d4aQ9D7V1 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Sh2d4aQ9D7V1 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Sh2d4aQ9D7V1 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Sh2d4aQ9D7V1 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Sh2d4aQ9D7V1 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Sh2d4aQ9D7V1 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Sh2d4aQ9D7V1 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Sh2d4aQ9D7V1 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Sh2d4aQ9D7V1 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Sh2d4aQ9D7V1 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Sh2d4aQ9D7V1 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Sh2d4aQ9D7V1 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Sh2d4aQ9D7V1 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
Sh2d4aQ9D7V1 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Sh2d4aQ9D7V1 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Sh2d4aQ9D7V1 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Sh2d4aQ9D7V1 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Sh2d4aQ9D7V1 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Sh2d4aQ9D7V1 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Sh2d4aQ9D7V1 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Sh2d4aQ9D7V1 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Sh2d4aQ9D7V1 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Sh2d4aQ9D7V1 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Sh2d4aQ9D7V1 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Sh2d4aQ9D7V1 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Sh2d4aQ9D7V1 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Sh2d4aQ9D7V1 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Sh2d4aQ9D7V1 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Sh2d4aQ9D7V1 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Sh2d4aQ9D7V1 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Sh2d4aQ9D7V1 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Sh2d4aQ9D7V1 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Sh2d4aQ9D7V1 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Sh2d4aQ9D7V1 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Sh2d4aQ9D7V1 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Sh2d4aQ9D7V1 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Sh2d4aQ9D7V1 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Sh2d4aQ9D7V1 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Sh2d4aQ9D7V1 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Sh2d4aQ9D7V1 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Sh2d4aQ9D7V1 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Sh2d4aQ9D7V1 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Sh2d4aQ9D7V1 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Sh2d4aQ9D7V1 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Sh2d4aQ9D7V1 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Sh2d4aQ9D7V1 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Sh2d4aQ9D7V1 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Sh2d4aQ9D7V1 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 161.9 ms