Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7A6

Srp19, Signal recognition particle 19 kDa protein, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srp19Q9D7A6 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
Srp19Q9D7A6 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Srp19Q9D7A6 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Srp19Q9D7A6 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Srp19Q9D7A6 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Srp19Q9D7A6 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Srp19Q9D7A6 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Srp19Q9D7A6 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Srp19Q9D7A6 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Srp19Q9D7A6 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Srp19Q9D7A6 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Srp19Q9D7A6 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Srp19Q9D7A6 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Srp19Q9D7A6 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Srp19Q9D7A6 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Srp19Q9D7A6 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Srp19Q9D7A6 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Srp19Q9D7A6 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Srp19Q9D7A6 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
Srp19Q9D7A6 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Srp19Q9D7A6 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Srp19Q9D7A6 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Srp19Q9D7A6 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Srp19Q9D7A6 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Srp19Q9D7A6 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Srp19Q9D7A6 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Srp19Q9D7A6 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Srp19Q9D7A6 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Srp19Q9D7A6 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
Srp19Q9D7A6 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Srp19Q9D7A6 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Srp19Q9D7A6 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Srp19Q9D7A6 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Srp19Q9D7A6 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Srp19Q9D7A6 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
Srp19Q9D7A6 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Srp19Q9D7A6 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Srp19Q9D7A6 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Srp19Q9D7A6 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Srp19Q9D7A6 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Srp19Q9D7A6 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Srp19Q9D7A6 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.74
Srp19Q9D7A6 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Srp19Q9D7A6 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Srp19Q9D7A6 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Srp19Q9D7A6 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Srp19Q9D7A6 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Srp19Q9D7A6 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Srp19Q9D7A6 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Srp19Q9D7A6 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Srp19Q9D7A6 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
Srp19Q9D7A6 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Srp19Q9D7A6 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Srp19Q9D7A6 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Srp19Q9D7A6 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Srp19Q9D7A6 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Srp19Q9D7A6 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Srp19Q9D7A6 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Srp19Q9D7A6 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Srp19Q9D7A6 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Srp19Q9D7A6 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Srp19Q9D7A6 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Srp19Q9D7A6 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Srp19Q9D7A6 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Srp19Q9D7A6 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Srp19Q9D7A6 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Srp19Q9D7A6 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Srp19Q9D7A6 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Srp19Q9D7A6 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Srp19Q9D7A6 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Srp19Q9D7A6 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Srp19Q9D7A6 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Srp19Q9D7A6 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Srp19Q9D7A6 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Srp19Q9D7A6 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Srp19Q9D7A6 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Srp19Q9D7A6 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Srp19Q9D7A6 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Srp19Q9D7A6 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Srp19Q9D7A6 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Srp19Q9D7A6 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Srp19Q9D7A6 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Srp19Q9D7A6 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Srp19Q9D7A6 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Srp19Q9D7A6 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Srp19Q9D7A6 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Srp19Q9D7A6 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
Srp19Q9D7A6 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Srp19Q9D7A6 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Srp19Q9D7A6 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Srp19Q9D7A6 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Srp19Q9D7A6 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Srp19Q9D7A6 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Srp19Q9D7A6 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Srp19Q9D7A6 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Srp19Q9D7A6 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Srp19Q9D7A6 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Srp19Q9D7A6 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Srp19Q9D7A6 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Srp19Q9D7A6 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.5 ms