Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6Z1

Nop56, Nucleolar protein 56, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nop56Q9D6Z1 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Nop56Q9D6Z1 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Nop56Q9D6Z1 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Nop56Q9D6Z1 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Nop56Q9D6Z1 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Nop56Q9D6Z1 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
Nop56Q9D6Z1 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Nop56Q9D6Z1 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Nop56Q9D6Z1 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Nop56Q9D6Z1 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Nop56Q9D6Z1 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Nop56Q9D6Z1 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
Nop56Q9D6Z1 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Nop56Q9D6Z1 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Nop56Q9D6Z1 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Nop56Q9D6Z1 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Nop56Q9D6Z1 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Nop56Q9D6Z1 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Nop56Q9D6Z1 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Nop56Q9D6Z1 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Nop56Q9D6Z1 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Nop56Q9D6Z1 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Nop56Q9D6Z1 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Nop56Q9D6Z1 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Nop56Q9D6Z1 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Nop56Q9D6Z1 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Nop56Q9D6Z1 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Nop56Q9D6Z1 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Nop56Q9D6Z1 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Nop56Q9D6Z1 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Nop56Q9D6Z1 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Nop56Q9D6Z1 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Nop56Q9D6Z1 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Nop56Q9D6Z1 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Nop56Q9D6Z1 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Nop56Q9D6Z1 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Nop56Q9D6Z1 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
Nop56Q9D6Z1 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Nop56Q9D6Z1 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Nop56Q9D6Z1 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Nop56Q9D6Z1 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Nop56Q9D6Z1 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Nop56Q9D6Z1 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
Nop56Q9D6Z1 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Nop56Q9D6Z1 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Nop56Q9D6Z1 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Nop56Q9D6Z1 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Nop56Q9D6Z1 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Nop56Q9D6Z1 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Nop56Q9D6Z1 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Nop56Q9D6Z1 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Nop56Q9D6Z1 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Nop56Q9D6Z1 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Nop56Q9D6Z1 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Nop56Q9D6Z1 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Nop56Q9D6Z1 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Nop56Q9D6Z1 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Nop56Q9D6Z1 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Nop56Q9D6Z1 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Nop56Q9D6Z1 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Nop56Q9D6Z1 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Nop56Q9D6Z1 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Nop56Q9D6Z1 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Nop56Q9D6Z1 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
Nop56Q9D6Z1 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Nop56Q9D6Z1 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Nop56Q9D6Z1 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
Nop56Q9D6Z1 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Nop56Q9D6Z1 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Nop56Q9D6Z1 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Nop56Q9D6Z1 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Nop56Q9D6Z1 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Nop56Q9D6Z1 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Nop56Q9D6Z1 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Nop56Q9D6Z1 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Nop56Q9D6Z1 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Nop56Q9D6Z1 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Nop56Q9D6Z1 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Nop56Q9D6Z1 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Nop56Q9D6Z1 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Nop56Q9D6Z1 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Nop56Q9D6Z1 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
Nop56Q9D6Z1 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Nop56Q9D6Z1 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Nop56Q9D6Z1 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Nop56Q9D6Z1 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Nop56Q9D6Z1 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Nop56Q9D6Z1 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Nop56Q9D6Z1 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Nop56Q9D6Z1 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Nop56Q9D6Z1 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Nop56Q9D6Z1 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Nop56Q9D6Z1 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Nop56Q9D6Z1 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Nop56Q9D6Z1 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Nop56Q9D6Z1 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Nop56Q9D6Z1 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Nop56Q9D6Z1 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Nop56Q9D6Z1 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Nop56Q9D6Z1 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 131.7 ms