Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5R4

Spata1, Spermatogenesis-associated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spata1Q9D5R4 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Spata1Q9D5R4 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Spata1Q9D5R4 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Spata1Q9D5R4 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Spata1Q9D5R4 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Spata1Q9D5R4 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Spata1Q9D5R4 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Spata1Q9D5R4 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Spata1Q9D5R4 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Spata1Q9D5R4 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Spata1Q9D5R4 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Spata1Q9D5R4 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Spata1Q9D5R4 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Spata1Q9D5R4 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Spata1Q9D5R4 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Spata1Q9D5R4 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Spata1Q9D5R4 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Spata1Q9D5R4 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Spata1Q9D5R4 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Spata1Q9D5R4 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Spata1Q9D5R4 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Spata1Q9D5R4 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Spata1Q9D5R4 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Spata1Q9D5R4 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Spata1Q9D5R4 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Spata1Q9D5R4 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Spata1Q9D5R4 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Spata1Q9D5R4 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Spata1Q9D5R4 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Spata1Q9D5R4 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Spata1Q9D5R4 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Spata1Q9D5R4 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Spata1Q9D5R4 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Spata1Q9D5R4 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Spata1Q9D5R4 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Spata1Q9D5R4 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Spata1Q9D5R4 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
Spata1Q9D5R4 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Spata1Q9D5R4 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Spata1Q9D5R4 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Spata1Q9D5R4 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Spata1Q9D5R4 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Spata1Q9D5R4 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Spata1Q9D5R4 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Spata1Q9D5R4 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Spata1Q9D5R4 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Spata1Q9D5R4 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Spata1Q9D5R4 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Spata1Q9D5R4 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Spata1Q9D5R4 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Spata1Q9D5R4 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Spata1Q9D5R4 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Spata1Q9D5R4 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Spata1Q9D5R4 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Spata1Q9D5R4 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Spata1Q9D5R4 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Spata1Q9D5R4 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Spata1Q9D5R4 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Spata1Q9D5R4 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Spata1Q9D5R4 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Spata1Q9D5R4 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Spata1Q9D5R4 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Spata1Q9D5R4 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Spata1Q9D5R4 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Spata1Q9D5R4 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
Spata1Q9D5R4 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Spata1Q9D5R4 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Spata1Q9D5R4 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
Spata1Q9D5R4 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Spata1Q9D5R4 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Spata1Q9D5R4 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Spata1Q9D5R4 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
Spata1Q9D5R4 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
Spata1Q9D5R4 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
Spata1Q9D5R4 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Spata1Q9D5R4 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Spata1Q9D5R4 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Spata1Q9D5R4 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Spata1Q9D5R4 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Spata1Q9D5R4 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Spata1Q9D5R4 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Spata1Q9D5R4 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Spata1Q9D5R4 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Spata1Q9D5R4 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
Spata1Q9D5R4 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Spata1Q9D5R4 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Spata1Q9D5R4 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Spata1Q9D5R4 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Spata1Q9D5R4 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Spata1Q9D5R4 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Spata1Q9D5R4 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Spata1Q9D5R4 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Spata1Q9D5R4 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Spata1Q9D5R4 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Spata1Q9D5R4 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Spata1Q9D5R4 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Spata1Q9D5R4 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Spata1Q9D5R4 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Spata1Q9D5R4 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Spata1Q9D5R4 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms