Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4V3

Ccdc83, Coiled-coil domain-containing protein 83, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc83Q9D4V3 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ccdc83Q9D4V3 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ccdc83Q9D4V3 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ccdc83Q9D4V3 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ccdc83Q9D4V3 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
Ccdc83Q9D4V3 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ccdc83Q9D4V3 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ccdc83Q9D4V3 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ccdc83Q9D4V3 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ccdc83Q9D4V3 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ccdc83Q9D4V3 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ccdc83Q9D4V3 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ccdc83Q9D4V3 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ccdc83Q9D4V3 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ccdc83Q9D4V3 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ccdc83Q9D4V3 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ccdc83Q9D4V3 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ccdc83Q9D4V3 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ccdc83Q9D4V3 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ccdc83Q9D4V3 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ccdc83Q9D4V3 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ccdc83Q9D4V3 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ccdc83Q9D4V3 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ccdc83Q9D4V3 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ccdc83Q9D4V3 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ccdc83Q9D4V3 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ccdc83Q9D4V3 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ccdc83Q9D4V3 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ccdc83Q9D4V3 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ccdc83Q9D4V3 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ccdc83Q9D4V3 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Ccdc83Q9D4V3 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ccdc83Q9D4V3 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ccdc83Q9D4V3 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ccdc83Q9D4V3 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ccdc83Q9D4V3 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ccdc83Q9D4V3 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ccdc83Q9D4V3 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ccdc83Q9D4V3 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ccdc83Q9D4V3 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
Ccdc83Q9D4V3 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ccdc83Q9D4V3 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Ccdc83Q9D4V3 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Ccdc83Q9D4V3 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Ccdc83Q9D4V3 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Ccdc83Q9D4V3 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ccdc83Q9D4V3 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ccdc83Q9D4V3 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ccdc83Q9D4V3 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ccdc83Q9D4V3 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ccdc83Q9D4V3 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ccdc83Q9D4V3 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ccdc83Q9D4V3 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ccdc83Q9D4V3 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ccdc83Q9D4V3 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ccdc83Q9D4V3 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ccdc83Q9D4V3 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ccdc83Q9D4V3 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Ccdc83Q9D4V3 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Ccdc83Q9D4V3 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ccdc83Q9D4V3 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ccdc83Q9D4V3 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ccdc83Q9D4V3 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ccdc83Q9D4V3 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ccdc83Q9D4V3 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ccdc83Q9D4V3 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ccdc83Q9D4V3 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ccdc83Q9D4V3 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ccdc83Q9D4V3 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ccdc83Q9D4V3 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ccdc83Q9D4V3 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ccdc83Q9D4V3 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ccdc83Q9D4V3 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ccdc83Q9D4V3 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ccdc83Q9D4V3 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
Ccdc83Q9D4V3 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ccdc83Q9D4V3 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ccdc83Q9D4V3 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ccdc83Q9D4V3 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ccdc83Q9D4V3 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ccdc83Q9D4V3 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Ccdc83Q9D4V3 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ccdc83Q9D4V3 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ccdc83Q9D4V3 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Ccdc83Q9D4V3 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Ccdc83Q9D4V3 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ccdc83Q9D4V3 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ccdc83Q9D4V3 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ccdc83Q9D4V3 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ccdc83Q9D4V3 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ccdc83Q9D4V3 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ccdc83Q9D4V3 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ccdc83Q9D4V3 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ccdc83Q9D4V3 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ccdc83Q9D4V3 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ccdc83Q9D4V3 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ccdc83Q9D4V3 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ccdc83Q9D4V3 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ccdc83Q9D4V3 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ccdc83Q9D4V3 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.9 ms