Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4Q1

Ribc2, RIB43A-like with coiled-coils protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 309 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ribc2Q9D4Q1 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC23,23■■□□□ 1,31
Ribc2Q9D4Q1 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,23■■□□□ 1,31
Ribc2Q9D4Q1 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,23■■□□□ 1,31
Ribc2Q9D4Q1 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,23■■□□□ 1,31
Ribc2Q9D4Q1 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC23,23■■□□□ 1,31
Ribc2Q9D4Q1 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23,22■■□□□ 1,31
Ribc2Q9D4Q1 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC23,22■■□□□ 1,31
Ribc2Q9D4Q1 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23,21■■□□□ 1,31
Ribc2Q9D4Q1 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,21■■□□□ 1,31
Ribc2Q9D4Q1 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC23,21■■□□□ 1,31
Ribc2Q9D4Q1 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23,19■■□□□ 1,3
Ribc2Q9D4Q1 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,18■■□□□ 1,3
Ribc2Q9D4Q1 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23,18■■□□□ 1,3
Ribc2Q9D4Q1 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,18■■□□□ 1,3
Ribc2Q9D4Q1 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC23,17■■□□□ 1,3
Ribc2Q9D4Q1 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC23,17■■□□□ 1,3
Ribc2Q9D4Q1 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,16■■□□□ 1,3
Ribc2Q9D4Q1 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,16■■□□□ 1,3
Ribc2Q9D4Q1 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,15■■□□□ 1,3
Ribc2Q9D4Q1 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,15■■□□□ 1,3
Ribc2Q9D4Q1 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC23,14■■□□□ 1,29
Ribc2Q9D4Q1 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,13■■□□□ 1,29
Ribc2Q9D4Q1 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,13■■□□□ 1,29
Ribc2Q9D4Q1 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23,12■■□□□ 1,29
Ribc2Q9D4Q1 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC23,12■■□□□ 1,29
Ribc2Q9D4Q1 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC23,12■■□□□ 1,29
Ribc2Q9D4Q1 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,12■■□□□ 1,29
Ribc2Q9D4Q1 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23,1■■□□□ 1,29
Ribc2Q9D4Q1 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23,09■■□□□ 1,29
Ribc2Q9D4Q1 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23,09■■□□□ 1,29
Ribc2Q9D4Q1 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23,09■■□□□ 1,29
Ribc2Q9D4Q1 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,07■■□□□ 1,28
Ribc2Q9D4Q1 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23,07■■□□□ 1,28
Ribc2Q9D4Q1 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23,07■■□□□ 1,28
Ribc2Q9D4Q1 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,07■■□□□ 1,28
Ribc2Q9D4Q1 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,07■■□□□ 1,28
Ribc2Q9D4Q1 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23,06■■□□□ 1,28
Ribc2Q9D4Q1 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC23,05■■□□□ 1,28
Ribc2Q9D4Q1 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC23,05■■□□□ 1,28
Ribc2Q9D4Q1 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23,05■■□□□ 1,28
Ribc2Q9D4Q1 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,04■■□□□ 1,28
Ribc2Q9D4Q1 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23,04■■□□□ 1,28
Ribc2Q9D4Q1 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC23,04■■□□□ 1,28
Ribc2Q9D4Q1 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23,04■■□□□ 1,28
Ribc2Q9D4Q1 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,02■■□□□ 1,28
Ribc2Q9D4Q1 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23,02■■□□□ 1,28
Ribc2Q9D4Q1 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23,01■■□□□ 1,27
Ribc2Q9D4Q1 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23,01■■□□□ 1,27
Ribc2Q9D4Q1 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC23,01■■□□□ 1,27
Ribc2Q9D4Q1 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1,27
Ribc2Q9D4Q1 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC23■■□□□ 1,27
Ribc2Q9D4Q1 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1,27
Ribc2Q9D4Q1 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1,27
Ribc2Q9D4Q1 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC22,99■■□□□ 1,27
Ribc2Q9D4Q1 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22,98■■□□□ 1,27
Ribc2Q9D4Q1 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22,97■■□□□ 1,27
Ribc2Q9D4Q1 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,97■■□□□ 1,27
Ribc2Q9D4Q1 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,97■■□□□ 1,27
Ribc2Q9D4Q1 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC22,97■■□□□ 1,27
Ribc2Q9D4Q1 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,97■■□□□ 1,27
Ribc2Q9D4Q1 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,97■■□□□ 1,27
Ribc2Q9D4Q1 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,97■■□□□ 1,27
Ribc2Q9D4Q1 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,96■■□□□ 1,27
Ribc2Q9D4Q1 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,94■■□□□ 1,26
Ribc2Q9D4Q1 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,94■■□□□ 1,26
Ribc2Q9D4Q1 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC22,94■■□□□ 1,26
Ribc2Q9D4Q1 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22,93■■□□□ 1,26
Ribc2Q9D4Q1 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC22,93■■□□□ 1,26
Ribc2Q9D4Q1 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22,93■■□□□ 1,26
Ribc2Q9D4Q1 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,93■■□□□ 1,26
Ribc2Q9D4Q1 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22,92■■□□□ 1,26
Ribc2Q9D4Q1 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC22,92■■□□□ 1,26
Ribc2Q9D4Q1 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,91■■□□□ 1,26
Ribc2Q9D4Q1 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC22,91■■□□□ 1,26
Ribc2Q9D4Q1 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,91■■□□□ 1,26
Ribc2Q9D4Q1 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22,91■■□□□ 1,26
Ribc2Q9D4Q1 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,91■■□□□ 1,26
Ribc2Q9D4Q1 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,9■■□□□ 1,26
Ribc2Q9D4Q1 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC22,89■■□□□ 1,26
Ribc2Q9D4Q1 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,87■■□□□ 1,25
Ribc2Q9D4Q1 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC22,86■■□□□ 1,25
Ribc2Q9D4Q1 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,86■■□□□ 1,25
Ribc2Q9D4Q1 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22,86■■□□□ 1,25
Ribc2Q9D4Q1 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,86■■□□□ 1,25
Ribc2Q9D4Q1 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,86■■□□□ 1,25
Ribc2Q9D4Q1 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,85■■□□□ 1,25
Ribc2Q9D4Q1 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC22,85■■□□□ 1,25
Ribc2Q9D4Q1 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22,85■■□□□ 1,25
Ribc2Q9D4Q1 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC22,85■■□□□ 1,25
Ribc2Q9D4Q1 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC22,85■■□□□ 1,25
Ribc2Q9D4Q1 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,85■■□□□ 1,25
Ribc2Q9D4Q1 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,84■■□□□ 1,25
Ribc2Q9D4Q1 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22,84■■□□□ 1,25
Ribc2Q9D4Q1 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,84■■□□□ 1,25
Ribc2Q9D4Q1 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22,83■■□□□ 1,25
Ribc2Q9D4Q1 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC22,82■■□□□ 1,24
Ribc2Q9D4Q1 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22,82■■□□□ 1,24
Ribc2Q9D4Q1 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC22,81■■□□□ 1,24
Ribc2Q9D4Q1 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC22,8■■□□□ 1,24
Ribc2Q9D4Q1 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22,79■■□□□ 1,24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18,9 ms