Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4K7

Ccdc105, Coiled-coil domain-containing protein 105, mousemouse

Predictions only

Length 499 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc105Q9D4K7 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Ccdc105Q9D4K7 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Ccdc105Q9D4K7 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Ccdc105Q9D4K7 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Ccdc105Q9D4K7 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Ccdc105Q9D4K7 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Ccdc105Q9D4K7 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Ccdc105Q9D4K7 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
Ccdc105Q9D4K7 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Ccdc105Q9D4K7 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Ccdc105Q9D4K7 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Ccdc105Q9D4K7 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Ccdc105Q9D4K7 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC27.54■■■□□ 2
Ccdc105Q9D4K7 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Ccdc105Q9D4K7 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Ccdc105Q9D4K7 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
Ccdc105Q9D4K7 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Ccdc105Q9D4K7 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Ccdc105Q9D4K7 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Ccdc105Q9D4K7 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Ccdc105Q9D4K7 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Ccdc105Q9D4K7 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Ccdc105Q9D4K7 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Ccdc105Q9D4K7 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Ccdc105Q9D4K7 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Ccdc105Q9D4K7 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Ccdc105Q9D4K7 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Ccdc105Q9D4K7 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Ccdc105Q9D4K7 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Ccdc105Q9D4K7 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Ccdc105Q9D4K7 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Ccdc105Q9D4K7 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Ccdc105Q9D4K7 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Ccdc105Q9D4K7 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Ccdc105Q9D4K7 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Ccdc105Q9D4K7 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Ccdc105Q9D4K7 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
Ccdc105Q9D4K7 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Ccdc105Q9D4K7 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Ccdc105Q9D4K7 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Ccdc105Q9D4K7 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Ccdc105Q9D4K7 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Ccdc105Q9D4K7 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Ccdc105Q9D4K7 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Ccdc105Q9D4K7 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Ccdc105Q9D4K7 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Ccdc105Q9D4K7 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Ccdc105Q9D4K7 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Ccdc105Q9D4K7 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Ccdc105Q9D4K7 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Ccdc105Q9D4K7 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Ccdc105Q9D4K7 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Ccdc105Q9D4K7 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Ccdc105Q9D4K7 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Ccdc105Q9D4K7 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Ccdc105Q9D4K7 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Ccdc105Q9D4K7 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Ccdc105Q9D4K7 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Ccdc105Q9D4K7 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
Ccdc105Q9D4K7 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
Ccdc105Q9D4K7 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Ccdc105Q9D4K7 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Ccdc105Q9D4K7 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Ccdc105Q9D4K7 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Ccdc105Q9D4K7 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Ccdc105Q9D4K7 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Ccdc105Q9D4K7 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Ccdc105Q9D4K7 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Ccdc105Q9D4K7 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Ccdc105Q9D4K7 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Ccdc105Q9D4K7 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Ccdc105Q9D4K7 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Ccdc105Q9D4K7 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Ccdc105Q9D4K7 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Ccdc105Q9D4K7 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Ccdc105Q9D4K7 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Ccdc105Q9D4K7 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Ccdc105Q9D4K7 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Ccdc105Q9D4K7 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Ccdc105Q9D4K7 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Ccdc105Q9D4K7 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Ccdc105Q9D4K7 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Ccdc105Q9D4K7 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Ccdc105Q9D4K7 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Ccdc105Q9D4K7 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Ccdc105Q9D4K7 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Ccdc105Q9D4K7 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Ccdc105Q9D4K7 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Ccdc105Q9D4K7 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Ccdc105Q9D4K7 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
Ccdc105Q9D4K7 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Ccdc105Q9D4K7 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
Ccdc105Q9D4K7 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Ccdc105Q9D4K7 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Ccdc105Q9D4K7 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Ccdc105Q9D4K7 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Ccdc105Q9D4K7 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Ccdc105Q9D4K7 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Ccdc105Q9D4K7 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Ccdc105Q9D4K7 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.7 ms