Protein–RNA interactions for Protein: Q9D478

Odf2l, Outer dense fiber protein 2-like, mousemouse

Predictions only

Length 642 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Odf2lQ9D478 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC29,28■■■□□ 2,28
Odf2lQ9D478 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC29,27■■■□□ 2,28
Odf2lQ9D478 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,26■■■□□ 2,28
Odf2lQ9D478 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,26■■■□□ 2,27
Odf2lQ9D478 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,26■■■□□ 2,27
Odf2lQ9D478 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,26■■■□□ 2,27
Odf2lQ9D478 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC29,25■■■□□ 2,27
Odf2lQ9D478 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,25■■■□□ 2,27
Odf2lQ9D478 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,23■■■□□ 2,27
Odf2lQ9D478 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC29,23■■■□□ 2,27
Odf2lQ9D478 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29,22■■■□□ 2,27
Odf2lQ9D478 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC29,21■■■□□ 2,27
Odf2lQ9D478 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC29,2■■■□□ 2,27
Odf2lQ9D478 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,2■■■□□ 2,27
Odf2lQ9D478 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,2■■■□□ 2,26
Odf2lQ9D478 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29,19■■■□□ 2,26
Odf2lQ9D478 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29,19■■■□□ 2,26
Odf2lQ9D478 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29,18■■■□□ 2,26
Odf2lQ9D478 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC29,18■■■□□ 2,26
Odf2lQ9D478 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,17■■■□□ 2,26
Odf2lQ9D478 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,17■■■□□ 2,26
Odf2lQ9D478 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC29,16■■■□□ 2,26
Odf2lQ9D478 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29,16■■■□□ 2,26
Odf2lQ9D478 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC29,16■■■□□ 2,26
Odf2lQ9D478 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC29,15■■■□□ 2,26
Odf2lQ9D478 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC29,15■■■□□ 2,26
Odf2lQ9D478 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC29,15■■■□□ 2,26
Odf2lQ9D478 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,14■■■□□ 2,26
Odf2lQ9D478 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC29,14■■■□□ 2,26
Odf2lQ9D478 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,14■■■□□ 2,25
Odf2lQ9D478 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29,13■■■□□ 2,25
Odf2lQ9D478 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC29,13■■■□□ 2,25
Odf2lQ9D478 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC29,12■■■□□ 2,25
Odf2lQ9D478 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC29,12■■■□□ 2,25
Odf2lQ9D478 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,1■■■□□ 2,25
Odf2lQ9D478 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC29,09■■■□□ 2,25
Odf2lQ9D478 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC29,08■■■□□ 2,25
Odf2lQ9D478 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC29,07■■■□□ 2,24
Odf2lQ9D478 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,06■■■□□ 2,24
Odf2lQ9D478 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC29,05■■■□□ 2,24
Odf2lQ9D478 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC29,05■■■□□ 2,24
Odf2lQ9D478 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,05■■■□□ 2,24
Odf2lQ9D478 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29,05■■■□□ 2,24
Odf2lQ9D478 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC29,04■■■□□ 2,24
Odf2lQ9D478 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29,03■■■□□ 2,24
Odf2lQ9D478 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,02■■■□□ 2,24
Odf2lQ9D478 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC29,02■■■□□ 2,24
Odf2lQ9D478 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC29,01■■■□□ 2,24
Odf2lQ9D478 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29,01■■■□□ 2,23
Odf2lQ9D478 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2,23
Odf2lQ9D478 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC29■■■□□ 2,23
Odf2lQ9D478 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2,23
Odf2lQ9D478 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC28,99■■■□□ 2,23
Odf2lQ9D478 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28,99■■■□□ 2,23
Odf2lQ9D478 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC28,99■■■□□ 2,23
Odf2lQ9D478 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28,98■■■□□ 2,23
Odf2lQ9D478 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28,98■■■□□ 2,23
Odf2lQ9D478 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC28,98■■■□□ 2,23
Odf2lQ9D478 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC28,98■■■□□ 2,23
Odf2lQ9D478 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC28,98■■■□□ 2,23
Odf2lQ9D478 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,97■■■□□ 2,23
Odf2lQ9D478 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC28,97■■■□□ 2,23
Odf2lQ9D478 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC28,97■■■□□ 2,23
Odf2lQ9D478 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28,96■■■□□ 2,23
Odf2lQ9D478 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC28,96■■■□□ 2,23
Odf2lQ9D478 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC28,95■■■□□ 2,22
Odf2lQ9D478 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,94■■■□□ 2,22
Odf2lQ9D478 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC28,94■■■□□ 2,22
Odf2lQ9D478 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC28,94■■■□□ 2,22
Odf2lQ9D478 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC28,94■■■□□ 2,22
Odf2lQ9D478 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28,93■■■□□ 2,22
Odf2lQ9D478 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC28,93■■■□□ 2,22
Odf2lQ9D478 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC28,93■■■□□ 2,22
Odf2lQ9D478 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28,93■■■□□ 2,22
Odf2lQ9D478 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC28,92■■■□□ 2,22
Odf2lQ9D478 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC28,91■■■□□ 2,22
Odf2lQ9D478 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,9■■■□□ 2,22
Odf2lQ9D478 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,88■■■□□ 2,21
Odf2lQ9D478 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28,88■■■□□ 2,21
Odf2lQ9D478 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,88■■■□□ 2,21
Odf2lQ9D478 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,87■■■□□ 2,21
Odf2lQ9D478 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28,87■■■□□ 2,21
Odf2lQ9D478 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,86■■■□□ 2,21
Odf2lQ9D478 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC28,86■■■□□ 2,21
Odf2lQ9D478 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,85■■■□□ 2,21
Odf2lQ9D478 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,85■■■□□ 2,21
Odf2lQ9D478 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC28,84■■■□□ 2,21
Odf2lQ9D478 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28,84■■■□□ 2,21
Odf2lQ9D478 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,82■■■□□ 2,2
Odf2lQ9D478 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,82■■■□□ 2,2
Odf2lQ9D478 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC28,82■■■□□ 2,2
Odf2lQ9D478 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,82■■■□□ 2,2
Odf2lQ9D478 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC28,82■■■□□ 2,2
Odf2lQ9D478 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC28,8■■■□□ 2,2
Odf2lQ9D478 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,79■■■□□ 2,2
Odf2lQ9D478 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,79■■■□□ 2,2
Odf2lQ9D478 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,78■■■□□ 2,2
Odf2lQ9D478 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28,77■■■□□ 2,2
Odf2lQ9D478 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,77■■■□□ 2,2
Odf2lQ9D478 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,77■■■□□ 2,2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20,5 ms